More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5332 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_3248  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  65.86 
 
 
543 aa  745    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5421  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 
546 aa  1120    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5711  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  99.82 
 
 
546 aa  1118    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  65.86 
 
 
543 aa  745    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102582  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11076  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  74.91 
 
 
543 aa  850    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0440642 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  59.14 
 
 
536 aa  647    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.894837  normal  0.430514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4589  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  61.04 
 
 
538 aa  651    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.335072  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  65.86 
 
 
543 aa  745    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.894285  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5332  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 
546 aa  1120    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.7188  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8848  AMP-dependent synthetase and ligase  58.93 
 
 
541 aa  649    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4358  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.66 
 
 
549 aa  617  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.124731 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0328  AMP-dependent synthetase and ligase  56.46 
 
 
540 aa  608  9.999999999999999e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2552  AMP-dependent synthetase and ligase  54.03 
 
 
575 aa  600  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3973  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.8 
 
 
545 aa  595  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  52.47 
 
 
552 aa  555  1e-156  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0444  AMP-dependent synthetase and ligase  50.74 
 
 
542 aa  532  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3283  AMP-dependent synthetase and ligase  47.59 
 
 
553 aa  504  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  45.34 
 
 
543 aa  500  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3348  AMP-dependent synthetase and ligase  46.47 
 
 
542 aa  495  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5439  medium-chain-fatty-acid-CoA ligase  44.07 
 
 
545 aa  482  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5172  AMP-dependent synthetase and ligase  44.49 
 
 
549 aa  479  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.569954  normal  0.858795 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1585  AMP-dependent synthetase and ligase  44.12 
 
 
549 aa  481  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0235  AMP-dependent synthetase and ligase  48.42 
 
 
538 aa  477  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  44.36 
 
 
544 aa  474  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.513748  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1930  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.76 
 
 
547 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.049446  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1907  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.76 
 
 
569 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.45334  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0159  AMP-dependent synthetase and ligase  44.61 
 
 
544 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.109446  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1895  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.93 
 
 
547 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1825  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.76 
 
 
584 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.754963  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0799  putative acyl-CoA synthetase  42.52 
 
 
546 aa  468  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0930157  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0905  AMP-dependent synthetase and ligase  46.8 
 
 
547 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6172  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.58 
 
 
569 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489705  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5208  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.02 
 
 
547 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.592335 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1367  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.02 
 
 
547 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0878998  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0622  AMP-dependent synthetase and ligase  43.74 
 
 
550 aa  448  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49286  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4293  putative acyl-CoA synthetase  42.09 
 
 
542 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0244741 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0759  putative acyl-CoA synthetase  42.36 
 
 
542 aa  449  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153349  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1769  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.19 
 
 
558 aa  450  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00212051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4392  AMP-dependent synthetase and ligase  43.39 
 
 
542 aa  448  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3738  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.58 
 
 
537 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739742  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1579  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.21 
 
 
537 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000333435  normal  0.0479837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0442  AMP-dependent synthetase and ligase  46.83 
 
 
546 aa  447  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172382  decreased coverage  0.00489815 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3649  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.02 
 
 
537 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1027  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.06 
 
 
560 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729958  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3332  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.02 
 
 
537 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000121528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  43.02 
 
 
537 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000368323  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2171  AMP-dependent synthetase and ligase  41.5 
 
 
546 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1398  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.02 
 
 
541 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4824  AMP-dependent synthetase and ligase  41.53 
 
 
551 aa  447  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal  0.874224 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1837  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.44 
 
 
541 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0196277  normal  0.206597 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5976  AMP-dependent synthetase and ligase  43.31 
 
 
551 aa  448  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.636472  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  42.2 
 
 
546 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3641  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.02 
 
 
537 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2108  AMP-dependent synthetase and ligase  44.92 
 
 
539 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2733  AMP-dependent synthetase and ligase  43.7 
 
 
542 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  0.088635 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3421  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.83 
 
 
537 aa  445  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000306697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3382  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.02 
 
 
537 aa  445  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000971977  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3660  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.02 
 
 
537 aa  445  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00222723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3690  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.83 
 
 
537 aa  445  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281571  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2141  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.62 
 
 
589 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2393  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.02 
 
 
542 aa  445  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0010153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2335  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.87 
 
 
546 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2982  AMP-dependent synthetase and ligase  42.88 
 
 
537 aa  441  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.874572  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2275  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.13 
 
 
562 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0961938  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0437  AMP-dependent synthetase and ligase  42.38 
 
 
547 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0809367  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3306  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.48 
 
 
545 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135648  normal  0.0145757 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2296  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.87 
 
 
546 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2946  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.9 
 
 
546 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.916006 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1439  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.87 
 
 
544 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.64772  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.87 
 
 
544 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1203  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.87 
 
 
544 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  42.59 
 
 
544 aa  438  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1930  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.87 
 
 
544 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.641249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1678  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.23 
 
 
545 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2455  putative acyl-CoA synthetase  41.12 
 
 
542 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.680464  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  41.62 
 
 
547 aa  436  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000420413  normal  0.904573 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1228  AMP-dependent synthetase and ligase  45.03 
 
 
540 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1799  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.09 
 
 
547 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2026  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.69 
 
 
545 aa  434  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4187  AMP-dependent synthetase and ligase  41.96 
 
 
545 aa  434  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554867  normal  0.517417 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0495  AMP-dependent synthetase and ligase  41.53 
 
 
553 aa  433  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.61838  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1749  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.14 
 
 
542 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0360029  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1925  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.73 
 
 
561 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113828  normal  0.439232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0212  AMP-dependent synthetase and ligase  42.72 
 
 
539 aa  430  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.240297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0617  putative acyl-CoA synthetase  41.87 
 
 
534 aa  430  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317505  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2456  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.71 
 
 
548 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2579  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.14 
 
 
542 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76612  normal  0.235984 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1267  putative acyl-CoA synthetase  40.19 
 
 
542 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2273  AMP-dependent synthetase and ligase  44.15 
 
 
533 aa  431  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2932  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.96 
 
 
547 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0465511  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4934  putative acyl-CoA synthetase  40.37 
 
 
542 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.115365  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1165  putative acyl-CoA synthetase  40.56 
 
 
542 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431504  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2845  AMP-dependent synthetase and ligase  42.29 
 
 
540 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.93 
 
 
542 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  41.33 
 
 
965 aa  426  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1455  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.11 
 
 
542 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0933982  hitchhiker  0.0000905753 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  40.87 
 
 
565 aa  425  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1913  AMP-dependent synthetase and ligase  40.4 
 
 
549 aa  427  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000707868  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1843  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.74 
 
 
556 aa  425  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1316  AMP-dependent synthetase and ligase  43.12 
 
 
546 aa  425  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>