61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5301 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5680  cellulase  100 
 
 
329 aa  658    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5390  cellulase  100 
 
 
329 aa  658    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.217743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5301  cellulase  100 
 
 
329 aa  658    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.104046  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5837  cellulase  79.03 
 
 
341 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1003  cellulase  83.49 
 
 
330 aa  495  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10061  cellulase celA1  61.9 
 
 
380 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0549134  normal  0.652249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3907  endoglucanase  48.61 
 
 
323 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0234  1, 4-beta cellobiohydrolase  49.48 
 
 
422 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  46.67 
 
 
491 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1657  glycoside hydrolase family protein  48.78 
 
 
495 aa  219  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0958307  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7197  cellulase  43.55 
 
 
393 aa  218  7.999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  44.91 
 
 
469 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  44.79 
 
 
459 aa  211  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  45.32 
 
 
446 aa  201  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  43.94 
 
 
456 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  43.01 
 
 
448 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  42.07 
 
 
441 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2166  Cellulase  42.91 
 
 
465 aa  193  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01440  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  39.88 
 
 
439 aa  193  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3215  glycoside hydrolase family 6  42.81 
 
 
438 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3501  cellulase  37.95 
 
 
346 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.67 
 
 
437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1738  glycoside hydrolase family 6  36.97 
 
 
419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304195  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4622  cellulase  40.61 
 
 
870 aa  182  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13180  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  38.62 
 
 
359 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0603055  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6330  Cellulase  38.52 
 
 
326 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.708114  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0518  Cellulase  35.67 
 
 
371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  40.86 
 
 
487 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0135  cellulase  34.36 
 
 
469 aa  158  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2131  Cellulase  35.41 
 
 
350 aa  152  5.9999999999999996e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2132  Cellulase  35.05 
 
 
394 aa  150  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1070  Cellulase  36.94 
 
 
361 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00218389  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3077  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  33.55 
 
 
487 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3078  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.95 
 
 
469 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4617  cellulase  36.07 
 
 
341 aa  133  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  29.12 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0236  glycoside hydrolase family 6  35.02 
 
 
501 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  30.51 
 
 
450 aa  107  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3602  glycoside hydrolase family 6  32.18 
 
 
434 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0359346  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  30.66 
 
 
655 aa  99.4  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  27.86 
 
 
611 aa  92.4  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  28.07 
 
 
605 aa  90.1  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  27.87 
 
 
646 aa  83.6  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  26.65 
 
 
1128 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  26.68 
 
 
1209 aa  79.3  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0598  cellulase  27.1 
 
 
628 aa  79  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.120048  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  27.95 
 
 
623 aa  76.3  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  27.76 
 
 
548 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  27.07 
 
 
588 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  27.07 
 
 
590 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2947  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.25 
 
 
452 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000458427  hitchhiker  0.00017321 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  28.53 
 
 
589 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1251  fibronectin, type III domain-containing protein  29.8 
 
 
497 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  26.24 
 
 
596 aa  73.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.75 
 
 
639 aa  73.2  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  28.18 
 
 
620 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  25.56 
 
 
767 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  26.53 
 
 
572 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.42 
 
 
633 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  27.05 
 
 
743 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  24.29 
 
 
791 aa  58.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>