More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5136 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0290  small GTP-binding protein  53.39 
 
 
770 aa  704    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2099  small GTP-binding protein  62.09 
 
 
719 aa  870    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00285281  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5155  elongation factor G  58.16 
 
 
674 aa  711    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212266  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2075  small GTP-binding protein  64.31 
 
 
708 aa  925    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.934925  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1361  elongation factor G  54.81 
 
 
722 aa  722    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3802  elongation factor G  55.8 
 
 
729 aa  769    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.812471  normal  0.705979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5517  elongation factor G  100 
 
 
713 aa  1430    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.469673 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0872  elongation factor G  59.6 
 
 
722 aa  759    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1772  elongation factor G  61 
 
 
717 aa  840    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.228015  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5136  elongation factor G  100 
 
 
713 aa  1430    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674006  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1785  elongation factor G  60.5 
 
 
717 aa  826    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6127  elongation factor G  64.19 
 
 
710 aa  881    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220969  normal  0.933466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10121  elongation factor G  77.82 
 
 
714 aa  1108    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5225  elongation factor G  100 
 
 
713 aa  1430    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.526168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2340  elongation factor G  61.87 
 
 
729 aa  858    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.468158  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2028  elongation factor G  58.35 
 
 
726 aa  768    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0521312  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1356  elongation factor G  63.33 
 
 
719 aa  905    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.335605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2732  small GTP-binding protein  55.67 
 
 
696 aa  677    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556066  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4599  elongation factor G  67.81 
 
 
701 aa  940    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.463727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2404  small GTP-binding protein  58.52 
 
 
718 aa  815    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136608  normal  0.0116105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2107  elongation factor G  61.57 
 
 
741 aa  604  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000230841  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  38.68 
 
 
695 aa  508  9.999999999999999e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  38.01 
 
 
694 aa  484  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  37.97 
 
 
682 aa  482  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  38.63 
 
 
679 aa  481  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  36.9 
 
 
696 aa  475  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  35.52 
 
 
692 aa  465  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  37.27 
 
 
696 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  39.26 
 
 
680 aa  460  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  39.61 
 
 
690 aa  456  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  37.37 
 
 
673 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  38.7 
 
 
683 aa  449  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  36.14 
 
 
695 aa  451  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  36.52 
 
 
691 aa  449  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  36.48 
 
 
673 aa  444  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  35.63 
 
 
670 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  34.95 
 
 
696 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  34 
 
 
697 aa  438  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.49 
 
 
682 aa  437  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  38.42 
 
 
686 aa  434  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  34.42 
 
 
697 aa  434  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  34.91 
 
 
701 aa  433  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  36.35 
 
 
694 aa  433  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  36.54 
 
 
692 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  34.76 
 
 
701 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  34.66 
 
 
696 aa  434  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  38.05 
 
 
683 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  35.11 
 
 
694 aa  429  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  35.72 
 
 
682 aa  432  1e-119  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  34.62 
 
 
697 aa  429  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  35.7 
 
 
667 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  35.09 
 
 
690 aa  424  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3702  small GTP-binding protein  40.4 
 
 
687 aa  421  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.805436  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  38.14 
 
 
688 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  36.52 
 
 
686 aa  422  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  35.38 
 
 
691 aa  422  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  34.81 
 
 
694 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  34.65 
 
 
691 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  36.49 
 
 
701 aa  419  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1453  elongation factor G  39.17 
 
 
677 aa  418  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.259372  normal  0.118188 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  34.93 
 
 
697 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0308  elongation factor G  34.18 
 
 
693 aa  418  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0116517  hitchhiker  0.00119531 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  35.24 
 
 
683 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  39.09 
 
 
701 aa  414  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2220  small GTP-binding protein  35.26 
 
 
693 aa  412  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280963  normal  0.116101 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  35 
 
 
685 aa  411  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  38.49 
 
 
701 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  38.26 
 
 
691 aa  412  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  36.79 
 
 
686 aa  411  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  34.86 
 
 
683 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  36.93 
 
 
707 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000313892  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  34.08 
 
 
693 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  35.53 
 
 
685 aa  405  1e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2690  elongation factor G  33.33 
 
 
691 aa  405  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2225  elongation factor G  36.43 
 
 
680 aa  403  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3227  small GTP-binding protein  40.74 
 
 
683 aa  404  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.717315  normal  0.0158872 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  35.48 
 
 
693 aa  404  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  36.56 
 
 
685 aa  404  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  34.8 
 
 
692 aa  400  9.999999999999999e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2103  elongation factor G  37.2 
 
 
688 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  34.04 
 
 
697 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  35.09 
 
 
689 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0346  elongation factor G  32.87 
 
 
691 aa  402  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  33.57 
 
 
697 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  36.12 
 
 
703 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  34.51 
 
 
692 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  34.76 
 
 
692 aa  399  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  34.52 
 
 
689 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  34.67 
 
 
692 aa  400  9.999999999999999e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  36.32 
 
 
687 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  34.24 
 
 
691 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  34.89 
 
 
695 aa  398  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  34.39 
 
 
689 aa  396  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  34.53 
 
 
692 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  33.19 
 
 
692 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  34.53 
 
 
692 aa  394  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0135  small GTP-binding protein  35.74 
 
 
699 aa  395  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.59489  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  34.84 
 
 
701 aa  393  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01510  small GTP-binding protein domain protein  35.37 
 
 
687 aa  394  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0222  elongation factor G  33.29 
 
 
691 aa  395  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>