More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5124 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  100 
 
 
346 aa  687    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  100 
 
 
346 aa  687    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  100 
 
 
346 aa  687    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  79.41 
 
 
347 aa  526  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  78.95 
 
 
348 aa  527  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3337  ABC transporter related  55.59 
 
 
367 aa  368  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1108  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  54.75 
 
 
425 aa  352  5e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.81433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  57.14 
 
 
360 aa  348  5e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  54.47 
 
 
361 aa  344  1e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  55.62 
 
 
368 aa  319  5e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  50 
 
 
353 aa  310  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  47.2 
 
 
337 aa  300  3e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  46.55 
 
 
349 aa  297  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  49.23 
 
 
344 aa  297  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5731  ABC transporter-related protein  49.55 
 
 
343 aa  297  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  50.64 
 
 
350 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.25 
 
 
382 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.97 
 
 
352 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  44.85 
 
 
363 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  44.8 
 
 
353 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  43.27 
 
 
349 aa  287  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.56 
 
 
354 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.22 
 
 
372 aa  287  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  43.27 
 
 
349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  44.51 
 
 
353 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4878  ABC transporter related  55.2 
 
 
387 aa  286  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.53709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0570  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.88 
 
 
365 aa  285  7e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124586  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.16 
 
 
370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  45.4 
 
 
364 aa  284  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  43.1 
 
 
353 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  44.76 
 
 
381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  42.69 
 
 
353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.45 
 
 
363 aa  282  5.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2400  ABC putrescine transporter, ATPase subunit  49.84 
 
 
334 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.35 
 
 
382 aa  281  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  50.49 
 
 
379 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 
353 aa  280  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0810  ABC transporter, ATP-binding protein  49.05 
 
 
370 aa  280  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.11 
 
 
345 aa  280  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  48.9 
 
 
363 aa  279  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  39.2 
 
 
367 aa  279  5e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  39.88 
 
 
329 aa  279  5e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 
353 aa  279  6e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  49.35 
 
 
352 aa  279  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.06 
 
 
359 aa  279  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  47.78 
 
 
362 aa  278  9e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.27 
 
 
353 aa  278  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0542  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.39 
 
 
377 aa  278  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  42.32 
 
 
386 aa  278  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  45.03 
 
 
353 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  45.4 
 
 
348 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  43.99 
 
 
341 aa  277  2e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  45.11 
 
 
366 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  44.61 
 
 
344 aa  277  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  48.87 
 
 
352 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.35 
 
 
360 aa  276  4e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  45.74 
 
 
352 aa  276  4e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  47.63 
 
 
352 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  46.1 
 
 
366 aa  275  6e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  48.85 
 
 
353 aa  275  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  45.28 
 
 
356 aa  275  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  46.1 
 
 
333 aa  275  7e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  46.84 
 
 
333 aa  275  7e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  44.52 
 
 
348 aa  275  8e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5873  ABC transporter related  47.56 
 
 
376 aa  275  8e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1474  ABC transporter related protein  46.2 
 
 
337 aa  275  8e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00799241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  43.02 
 
 
357 aa  275  9e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  46.1 
 
 
333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  48.23 
 
 
363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  47.06 
 
 
342 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.59 
 
 
365 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2375  ABC transporter related protein  44.12 
 
 
347 aa  273  2.0000000000000002e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  46.51 
 
 
333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.6 
 
 
356 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  41.49 
 
 
343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0758  ABC transporter related  48.84 
 
 
365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  48.29 
 
 
383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  47.9 
 
 
363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6092  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (polyamine)  41.36 
 
 
358 aa  273  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196126  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  47.48 
 
 
368 aa  273  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.12 
 
 
366 aa  273  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  47.68 
 
 
356 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  44.84 
 
 
350 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  42.74 
 
 
357 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  48.28 
 
 
363 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  45.78 
 
 
333 aa  272  6e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4444  ABC transporter related  44.25 
 
 
359 aa  272  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  40.11 
 
 
348 aa  272  6e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  46.29 
 
 
399 aa  272  6e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  37.89 
 
 
356 aa  272  6e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  44.77 
 
 
353 aa  272  7e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  45.13 
 
 
338 aa  271  9e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2127  ABC transporter related  43.88 
 
 
337 aa  271  9e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0500595  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  45.27 
 
 
372 aa  271  9e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  45.93 
 
 
352 aa  271  1e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  44.44 
 
 
352 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  44.38 
 
 
369 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8306  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.47 
 
 
347 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.646948  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  47.83 
 
 
366 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1109  ABC transporter related  41.03 
 
 
323 aa  270  2e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.79033  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>