More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5059 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5438  DNA polymerase IV  98.53 
 
 		 407 aa  786    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5059  DNA polymerase IV  100 
 
 		 407 aa  797    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5147  DNA polymerase IV  100 
 
 		 407 aa  797    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5685  DNA polymerase IV  85.29 
 
 		 424 aa  659    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  82.08 
 
 		 413 aa  632  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  65.75 
 
 		 407 aa  477  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1021  DNA polymerase IV  66.33 
 
 		 401 aa  474  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.6656  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  63.25 
 
 		 402 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  61.11 
 
 		 419 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3609  DNA-directed DNA polymerase  60.1 
 
 		 405 aa  428  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0380  DNA-directed DNA polymerase  58 
 
 		 358 aa  328  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154021  decreased coverage  0.00759765 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  50 
 
 		 421 aa  322  6e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3810  DNA polymerase IV  47.94 
 
 		 428 aa  317  3e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0803828  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  43.07 
 
 		 415 aa  277  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  45.57 
 
 		 430 aa  276  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  45.08 
 
 		 410 aa  272  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  42.89 
 
 		 420 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  42.89 
 
 		 410 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  45.23 
 
 		 418 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  43.4 
 
 		 422 aa  267  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  43.43 
 
 		 409 aa  268  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  45.23 
 
 		 418 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  40.16 
 
 		 399 aa  266  4e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  45 
 
 		 430 aa  266  4e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  44.97 
 
 		 418 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  46.63 
 
 		 407 aa  266  5.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  41.81 
 
 		 408 aa  265  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  46.41 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  47.51 
 
 		 419 aa  264  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  45.19 
 
 		 415 aa  263  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  44.86 
 
 		 402 aa  263  4.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  37.79 
 
 		 393 aa  262  6.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  43.8 
 
 		 424 aa  261  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  43.22 
 
 		 414 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  47.51 
 
 		 419 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  43.63 
 
 		 363 aa  255  9e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  41.04 
 
 		 408 aa  255  9e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  42.41 
 
 		 406 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  43.48 
 
 		 378 aa  254  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  43.48 
 
 		 378 aa  254  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  40.36 
 
 		 412 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  42.03 
 
 		 431 aa  249  4e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  38.28 
 
 		 425 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  35.23 
 
 		 385 aa  246  4e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  41.98 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  34.44 
 
 		 408 aa  243  3.9999999999999997e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  39.73 
 
 		 380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  40.79 
 
 		 834 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  38.42 
 
 		 400 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  39.33 
 
 		 359 aa  241  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  37.98 
 
 		 384 aa  241  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  41.29 
 
 		 374 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  40.84 
 
 		 407 aa  239  5.999999999999999e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  41.48 
 
 		 385 aa  238  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  38.27 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  41.34 
 
 		 466 aa  237  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  36.93 
 
 		 413 aa  235  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  39.44 
 
 		 356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  35.73 
 
 		 371 aa  232  8.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  38.37 
 
 		 373 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  35.19 
 
 		 409 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  40.51 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  36.78 
 
 		 385 aa  229  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  39.64 
 
 		 417 aa  230  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  40.47 
 
 		 376 aa  230  4e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  41.48 
 
 		 383 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  41.48 
 
 		 361 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  39.59 
 
 		 386 aa  230  4e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  41.48 
 
 		 408 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  39.64 
 
 		 449 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  35.98 
 
 		 358 aa  229  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  38.59 
 
 		 378 aa  229  6e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  39.17 
 
 		 354 aa  229  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  31.94 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  34.67 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  38.18 
 
 		 375 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  40.17 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  40.95 
 
 		 355 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  37.07 
 
 		 369 aa  227  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  34.11 
 
 		 359 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  37.7 
 
 		 378 aa  228  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  37.08 
 
 		 423 aa  226  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  36.5 
 
 		 453 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  37.53 
 
 		 426 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  37.11 
 
 		 445 aa  224  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  37.92 
 
 		 363 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  37.82 
 
 		 429 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1686  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  36.65 
 
 		 424 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  32.66 
 
 		 359 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  40.88 
 
 		 356 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  35.07 
 
 		 372 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  40.62 
 
 		 379 aa  223  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  36.88 
 
 		 417 aa  222  8e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  36.86 
 
 		 445 aa  222  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  40.56 
 
 		 395 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  39.12 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  33.7 
 
 		 360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3990  DNA polymerase IV  38.78 
 
 		 353 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0076  DNA-directed DNA polymerase  42.82 
 
 		 577 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  36.36 
 
 		 359 aa  219  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>