43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5036 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5036  abortive infection protein  100 
 
 
259 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5124  abortive infection protein  100 
 
 
259 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5417  abortive infection protein  98.84 
 
 
259 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  76.74 
 
 
255 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  74.81 
 
 
256 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  72.44 
 
 
264 aa  353  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  72.05 
 
 
257 aa  353  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  73.2 
 
 
268 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  73.2 
 
 
268 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0085  Abortive infection protein  52.53 
 
 
264 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  50.21 
 
 
241 aa  207  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0173  Abortive infection protein  49.03 
 
 
268 aa  204  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.559732  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0216  Abortive infection protein  46.72 
 
 
277 aa  202  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0137  Abortive infection protein  48.44 
 
 
259 aa  199  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4542  abortive infection protein  45.31 
 
 
256 aa  176  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.651629  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6578  abortive infection protein  48.57 
 
 
286 aa  172  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25550  CAAX amino terminal protease family  47.97 
 
 
253 aa  170  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4120  abortive infection protein  46.44 
 
 
256 aa  170  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3509  abortive infection protein  46.18 
 
 
267 aa  169  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.585931  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3452  Abortive infection protein  43.36 
 
 
282 aa  166  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1205  Abortive infection protein  42.58 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.69996  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36220  CAAX amino terminal protease family  43.08 
 
 
269 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.731367  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1424  Abortive infection protein  43.32 
 
 
273 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1358  Abortive infection protein  39.15 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3260  Abortive infection protein  40.65 
 
 
293 aa  152  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1315  abortive infection protein  41.43 
 
 
255 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0933  abortive infection protein  44.57 
 
 
296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.160537  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04670  CAAX amino terminal protease family  55.06 
 
 
302 aa  145  7.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.767704  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4773  Abortive infection protein  41.02 
 
 
269 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2503  Abortive infection protein  42.15 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0727648  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4030  Abortive infection protein  43.35 
 
 
242 aa  135  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06020  hypothetical protein  39.11 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.334826  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1376  hypothetical protein  41.06 
 
 
437 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0258  abortive infection protein  56.56 
 
 
272 aa  126  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.750213 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1943  abortive infection protein  33.33 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.142056  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  31.58 
 
 
242 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  32.12 
 
 
235 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1534  Abortive infection protein  34.41 
 
 
120 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.257594 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0732  abortive infection protein  29.11 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2139  abortive infection protein  32.56 
 
 
210 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.317172  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  31.4 
 
 
299 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1161  abortive infection protein  33.7 
 
 
272 aa  43.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.422922 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  31.65 
 
 
278 aa  42  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>