More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4970 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4970  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
203 aa  407  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5058  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
203 aa  407  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5351  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
203 aa  407  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1203  phosphoglycerate mutase  78.82 
 
 
203 aa  332  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5604  phosphoglycerate mutase  77.34 
 
 
202 aa  317  7e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335394  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  25.82 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1891  phosphoglycerate mutase  28.36 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1881  phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1929  phosphoglycerate mutase family protein  27.36 
 
 
196 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2076  phosphoglycerate mutase family protein  27.36 
 
 
196 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2107  phosphoglycerate mutase family protein  27.36 
 
 
196 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2160  phosphoglycerate mutase family protein  27.78 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2175  phosphoglycerate mutase family protein  27.78 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.778045  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2851  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 
189 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.796237  normal  0.0465369 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3241  phosphoglycerate mutase family protein  26.77 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0777453  normal  0.210221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.22 
 
 
427 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1926  phosphoglycerate mutase  26.77 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00641926  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 
210 aa  64.3  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  31.45 
 
 
223 aa  62.8  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2066  phosphoglycerate mutase family protein  25.76 
 
 
196 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.24 
 
 
222 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 
222 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  30.27 
 
 
200 aa  60.5  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0564  phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 
201 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 
201 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2641  Phosphoglycerate mutase  38.36 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  26.54 
 
 
206 aa  58.9  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 
215 aa  58.5  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 
215 aa  58.5  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 
215 aa  58.5  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  27.47 
 
 
211 aa  58.5  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  23.24 
 
 
201 aa  58.5  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  25.82 
 
 
188 aa  58.2  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  32.3 
 
 
203 aa  58.2  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  26.87 
 
 
217 aa  58.2  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.74 
 
 
382 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 
240 aa  57.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  26.7 
 
 
207 aa  57.4  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40850  hypothetical protein  29.65 
 
 
236 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
198 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.8 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.8 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  24.86 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  28.02 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  24.84 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3465  hypothetical protein  29.2 
 
 
236 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.940841  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 
224 aa  55.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  28.8 
 
 
200 aa  55.5  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  33.76 
 
 
225 aa  55.5  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  25.73 
 
 
207 aa  55.8  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  25.61 
 
 
215 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  25.61 
 
 
215 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3557  phosphoglycerate mutase  29.02 
 
 
236 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370519  normal  0.395273 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3985  Phosphoglycerate mutase  29.2 
 
 
212 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.634777 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
223 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2726  hypothetical protein  28.12 
 
 
236 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 
234 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3212  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
236 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1207  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.28 
 
 
162 aa  54.7  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  32.1 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 
412 aa  53.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1922  phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165977  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3778  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  35.19 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  35.15 
 
 
242 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3115  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.23 
 
 
236 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217101  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  31.77 
 
 
220 aa  52.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57574  putative transcription initiation factor  37.37 
 
 
439 aa  52.8  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.625866 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  33.96 
 
 
233 aa  52.8  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 
224 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.13 
 
 
369 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 
200 aa  52  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 
202 aa  52  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 
273 aa  51.6  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  26.23 
 
 
200 aa  51.6  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  28.89 
 
 
214 aa  51.6  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  28.89 
 
 
214 aa  51.6  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  31.45 
 
 
195 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0266  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0265  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  29.09 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2531  phosphoglycerate mutase  25.91 
 
 
232 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186608  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  32.9 
 
 
220 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  50.91 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  37.5 
 
 
292 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3923  phosphoglycerate mutase  27.68 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0493015 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  28.66 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  38.55 
 
 
236 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  29.15 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 
223 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 
238 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2660  Phosphoglycerate mutase  33.11 
 
 
181 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000126971  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  30.5 
 
 
411 aa  50.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 
238 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 
238 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>