21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4830 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4830  putative ATP-binding protein  100 
 
 		 525 aa  1060    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4450  putative ATP-binding protein  88.06 
 
 		 427 aa  753    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.403742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4916  putative ATP-binding protein  100 
 
 		 377 aa  736    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4918  putative ATP-binding protein  99.38 
 
 		 160 aa  326  5e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  42.92 
 
 		 880 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1199  putative ATP-binding protein  42.76 
 
 		 545 aa  291  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0498844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1258  hypothetical protein  33.25 
 
 		 650 aa  192  9e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1598  hypothetical protein  37.36 
 
 		 521 aa  189  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0796  hypothetical protein  31.49 
 
 		 535 aa  182  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1348  hypothetical protein  34.8 
 
 		 643 aa  174  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  32.22 
 
 		 739 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2066  hypothetical protein  30.27 
 
 		 636 aa  171  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0023  hypothetical protein  29.5 
 
 		 576 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.640701  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1539  hypothetical protein  31.37 
 
 		 399 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1122  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 572 aa  163  8.000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1015  hypothetical protein  31.73 
 
 		 701 aa  161  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.693082  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1612  hypothetical protein  27.73 
 
 		 866 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.514221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4453  putative ATP-binding protein  72.28 
 
 		 122 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2087  AAA ATPase  31.06 
 
 		 685 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  31.35 
 
 		 746 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3378  hypothetical protein  35.24 
 
 		 317 aa  116  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>