51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4806 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4806  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  650    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.723828  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4892  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  650    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5193  hypothetical protein  96.88 
 
 		 353 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000272361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5422  hypothetical protein  57.3 
 
 		 365 aa  355  5e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1383  hypothetical protein  60.06 
 
 		 365 aa  348  7e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.068723  normal  0.317281 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13690  hypothetical protein  60 
 
 		 350 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00103627  normal  0.200408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0728  hypothetical protein  45.32 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3909  hypothetical protein  47.66 
 
 		 355 aa  179  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0275  hypothetical protein  47.66 
 
 		 371 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35930  hypothetical protein  40.84 
 
 		 364 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.184188 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0517  hypothetical protein  42.56 
 
 		 352 aa  166  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4839  hypothetical protein  43.08 
 
 		 359 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0479  hypothetical protein  41.74 
 
 		 348 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0213  chromosome partitioning-like ATPase  35.19 
 
 		 346 aa  137  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4422  hypothetical protein  40.32 
 
 		 366 aa  135  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5871  hypothetical protein  35.24 
 
 		 369 aa  129  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000185366  normal  0.407546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4040  hypothetical protein  40.76 
 
 		 366 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0591  septum site determining protein  44.04 
 
 		 357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1983  septum site determining protein  33.84 
 
 		 403 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0129  putative septum site determining protein  37.38 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3162  hypothetical protein  33.62 
 
 		 362 aa  97.1  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0841875 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3373  hypothetical protein  31.4 
 
 		 325 aa  96.7  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0053  hypothetical protein  44.12 
 
 		 569 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0363  septum site determining protein  31.86 
 
 		 348 aa  89.7  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000346854  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0476  hypothetical protein  42.44 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000368033  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0323  flp pilus assembly protein FlpE  35.81 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264858  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0618  hypothetical protein  39 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2225  hypothetical protein  38.89 
 
 		 265 aa  58.9  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33370  hypothetical protein  32.42 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.066941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5329  putative septum site determining protein  34.83 
 
 		 301 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.499327  normal  0.108162 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  25.6 
 
 		 587 aa  50.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  25.57 
 
 		 444 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  25.48 
 
 		 416 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.91 
 
 		 423 aa  50.1  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2558  septum site-determining protein MinD  27.78 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4296  putative septum site determining protein  31.4 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25810  hypothetical protein  32.77 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0093  septum site-determining protein MinD  26.25 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000203093  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2778  flp pilus assembly protein FlpE  33.75 
 
 		 229 aa  46.2  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  hitchhiker  0.0000109666 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1534  septum site-determining protein MinD  25.86 
 
 		 264 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341054  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2150  septum site-determining protein MinD  22.64 
 
 		 270 aa  45.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000174777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1809  septum site-determining protein MinD  21.95 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0710931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2091  septum site-determining protein MinD  21.95 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0260  septum site-determining protein MinD  24.7 
 
 		 273 aa  44.7  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.148495  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2543  septum site-determining protein MinD  27.16 
 
 		 264 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 		 265 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.43 
 
 		 389 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2105  septum site-determining protein MinD  27.16 
 
 		 265 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000589774  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2393  septum site-determining protein MinD  27.16 
 
 		 265 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000328791  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25310  hypothetical protein  42.68 
 
 		 235 aa  43.1  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0871  ParA protein  26.47 
 
 		 300 aa  42.7  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>