284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4719 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4719  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 298 aa  591  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4805  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 298 aa  591  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.457429  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5104  periplasmic solute binding protein  98.66 
 
 		 298 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.861086  normal  0.244188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1454  periplasmic solute binding protein  64.08 
 
 		 339 aa  388  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5320  periplasmic solute binding protein  61.88 
 
 		 343 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723333 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2086  periplasmic solute binding protein  40.73 
 
 		 330 aa  186  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0747  Mn2+/Zn2+ ABC transporter periplasmic protein  36.84 
 
 		 398 aa  172  6.999999999999999e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0697  periplasmic solute binding protein  37.68 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2479  periplasmic solute binding protein  35.16 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1169  periplasmic solute binding protein  33.58 
 
 		 317 aa  161  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.693162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2641  periplasmic solute binding protein  36.54 
 
 		 321 aa  159  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2613  periplasmic solute binding protein  34.72 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.340349  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3249  periplasmic solute binding protein  35.66 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.284399  normal  0.365665 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0883  metal ion ABC transporter periplasmic protein  34.81 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.194298  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3195  periplasmic solute binding protein  37.86 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0732077 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0717  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, periplasmic ligand binding protein  35.66 
 
 		 330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1990  periplasmic solute binding protein  37.45 
 
 		 303 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2624  periplasmic solute binding protein  37.45 
 
 		 303 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2600  periplasmic solute binding protein  37.45 
 
 		 303 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0292  periplasmic solute binding protein  36.36 
 
 		 329 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2516  periplasmic solute binding protein  37.36 
 
 		 304 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.322122 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0866  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  37.5 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1029  ABC transporter substrate binding protein  37.13 
 
 		 393 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0626  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  37.13 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.695512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2460  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  37.13 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0870  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  37.13 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0074  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  37.13 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0328  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  37.13 
 
 		 291 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344237  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2376  periplasmic solute binding protein  34.65 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000812872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2648  periplasmic solute binding protein  36.98 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0352  periplasmic solute binding protein  35.15 
 
 		 296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1958  periplasmic solute binding protein  35.19 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4923  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 316 aa  142  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5931  ABC heavy metal transporter, periplasmic ligand binding protein  36.36 
 
 		 304 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0754  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.130073 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0602  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  33.33 
 
 		 294 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1188  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.31 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0487  periplasmic solute binding protein  34.32 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0440527  hitchhiker  0.00169017 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0690  ABC transporter solute-binding protein  35.52 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2019  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.42 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0239  periplasmic solute binding protein  32.18 
 
 		 310 aa  132  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527409  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0986  periplasmic solute binding protein  32.19 
 
 		 312 aa  132  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12096  hypothetical protein  33.85 
 
 		 511 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000121377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2369  periplasmic solute binding protein  35.07 
 
 		 306 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00739211  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35300  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  34.98 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0803  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000167329  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0599  periplasmic solute binding family protein  27.63 
 
 		 350 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0611  periplasmic solute binding protein  34.4 
 
 		 298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1279  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  24.32 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0216  periplasmic solute binding protein  26.37 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799126  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1722  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25.68 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000557387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  26.2 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  27.54 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  26.94 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  27.57 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  23.08 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  27.5 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  26.81 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  26.56 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  23.08 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  27.73 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  25.82 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  22.06 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  31.03 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  23.27 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  31.32 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  24.05 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  30.61 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  30.72 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  27.72 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  23.18 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  32.12 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  27.78 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  33.08 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  27.95 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  30.53 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  25.53 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  25.18 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  20.62 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  25.21 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  23.64 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  26.46 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  25.1 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  27.82 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  30.14 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  21.56 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  24.7 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  29.45 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  24.9 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  22.18 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  24.73 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3927  periplasmic solute binding protein  27.97 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.51869  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  25.84 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  29.51 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  25.84 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  27.43 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  26.87 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03390  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.05 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.563003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  24.19 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  26.39 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>