222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4642 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4642  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 457 aa  915    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.921462  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4730  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 548 aa  917    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5025  polysaccharide deacetylase  98.03 
 
 		 548 aa  900    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.794076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  34.3 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 		 347 aa  91.3  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  27.08 
 
 		 298 aa  90.1  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 285 aa  87  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  34.81 
 
 		 276 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2105  polysaccharide deacetylase  31.72 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0828766  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  44.87 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  30.25 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  34.81 
 
 		 276 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  35.59 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  35.77 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  34.96 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4607  outer membrane N-deacetylase  28.57 
 
 		 671 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3514  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 697 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000898006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  39.39 
 
 		 318 aa  76.3  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3997  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 697 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695216  normal  0.336374 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2295  intercellular adhesion protein B  28.77 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0572032  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  26.94 
 
 		 673 aa  75.5  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  28.9 
 
 		 319 aa  72.8  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  33.78 
 
 		 319 aa  73.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4263  polysaccharide deacetylase  30.11 
 
 		 697 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4103  polysaccharide deacetylase  30.11 
 
 		 697 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.871871  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4286  outer membrane N-deacetylase  27.59 
 
 		 671 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3420  polysaccharide deacetylase  30.11 
 
 		 698 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01025  predicted enzyme associated with biofilm formation  28.28 
 
 		 672 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2620  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 		 672 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  31.29 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1941  polysaccharide deacetylase  28.92 
 
 		 697 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2573  outer membrane N-deacetylase  28.28 
 
 		 672 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0269291 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  27.74 
 
 		 626 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  35.56 
 
 		 276 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01032  hypothetical protein  28.28 
 
 		 672 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.29 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1143  outer membrane N-deacetylase  28.28 
 
 		 672 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1265  outer membrane N-deacetylase  28.28 
 
 		 672 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.798831 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1138  outer membrane N-deacetylase  28.28 
 
 		 672 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115575  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  27.35 
 
 		 724 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0178  outer membrane N-deacetylase  27.19 
 
 		 665 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2322  polysaccharide deacetylase family protein  31.29 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  35.92 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  29.75 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  27.57 
 
 		 628 aa  67  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  29.88 
 
 		 426 aa  67  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2204  polysaccharide deacetylase  39.02 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0196  polysaccharide deacetylase domain protein  30.61 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  33.33 
 
 		 265 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4483  polysaccharide deacetylase  27.84 
 
 		 695 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367373  normal  0.863016 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  30 
 
 		 290 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  30 
 
 		 290 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  30 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 		 645 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0195  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  33.04 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0199  polysaccharide deacetylase domain protein  33.04 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.37766  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  31.01 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  29.37 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  32.43 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  32.43 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 		 659 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  25.12 
 
 		 673 aa  63.9  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  25.12 
 
 		 673 aa  63.9  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  25.12 
 
 		 673 aa  63.9  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  32.43 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  32.43 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  32.43 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  31.1 
 
 		 712 aa  63.2  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  31.1 
 
 		 712 aa  63.2  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  32.43 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  27.27 
 
 		 624 aa  62.4  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 		 1015 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  33.1 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0846  polysaccharide deacetylase  33.64 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  28.65 
 
 		 660 aa  60.1  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  28.65 
 
 		 659 aa  60.1  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1014  polysaccharide deacetylase family protein  33.04 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  34.4 
 
 		 266 aa  59.7  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  34 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  28.49 
 
 		 640 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3475  polysaccharide deacetylase  33.04 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3346  polysaccharide deacetylase family protein  33.04 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000257148  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0570  polysaccharide deacetylase  38.64 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0342536 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  31.97 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  28.19 
 
 		 615 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  31.18 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  28.19 
 
 		 615 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  26.62 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1105  polysaccharide deacetylase  27.66 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  25.57 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  27.91 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  39.44 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  27.91 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  27.91 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>