42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4634 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5016  hypothetical protein  98.52 
 
 
338 aa  672    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4722  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  680    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4634  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  680    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5220  hypothetical protein  79.88 
 
 
330 aa  547  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146278  normal  0.27671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1538  hypothetical protein  79.13 
 
 
332 aa  541  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13554  hypothetical protein  75.59 
 
 
334 aa  521  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150735 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3818  protein of unknown function DUF35  59.19 
 
 
320 aa  386  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2732  hypothetical protein  57.45 
 
 
319 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3964  protein of unknown function DUF35  55.86 
 
 
329 aa  356  2.9999999999999997e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2642  hypothetical protein  55.11 
 
 
329 aa  347  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13056  normal  0.212134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2839  hypothetical protein  54.6 
 
 
319 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11529  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3090  protein of unknown function DUF35  43.61 
 
 
335 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1482  nucleic-acid-binding protein containing a Zn- ribbon-like protein  46.77 
 
 
295 aa  245  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3983  protein of unknown function DUF35  44.62 
 
 
309 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.411104  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2783  protein of unknown function DUF35  32.61 
 
 
165 aa  72  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.103009  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2762  hypothetical protein  33.79 
 
 
158 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.10983  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0269  hypothetical protein  31.37 
 
 
165 aa  67.8  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000709024  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  36.21 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  32.54 
 
 
142 aa  54.7  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3784  protein of unknown function DUF35  30.23 
 
 
165 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.0099748  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  28.16 
 
 
178 aa  55.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  32.38 
 
 
128 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  30.3 
 
 
134 aa  50.8  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  33.94 
 
 
121 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  31.18 
 
 
130 aa  50.4  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  34.25 
 
 
177 aa  49.3  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2276  hypothetical protein  29.36 
 
 
123 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0268  hypothetical protein  30.63 
 
 
141 aa  47.8  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00125281  normal  0.120379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  47.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  31.11 
 
 
141 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  34.31 
 
 
141 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  34.62 
 
 
129 aa  47  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  38.57 
 
 
151 aa  46.6  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  29.1 
 
 
189 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  29.2 
 
 
132 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  31.19 
 
 
130 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  31.86 
 
 
132 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  27.73 
 
 
130 aa  43.9  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  27.87 
 
 
135 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  30.19 
 
 
119 aa  43.5  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  30.1 
 
 
138 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  25.66 
 
 
129 aa  42.7  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>