89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4599 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_4687  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  258  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.938397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4599  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  258  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4982  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  258  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3947  protein of unknown function DUF1232  61.17 
 
 
130 aa  84  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34353  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2458  protein of unknown function DUF1232  65.91 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  35.66 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  36.22 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1038  hypothetical protein  39.56 
 
 
171 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3693  hypothetical protein  40.66 
 
 
211 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1704  hypothetical protein  28 
 
 
323 aa  57  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0800873  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1437  hypothetical protein  28 
 
 
323 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.973186  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06321  hypothetical protein  52 
 
 
122 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06021  hypothetical protein  52 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0576  hypothetical protein  52 
 
 
122 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.64986  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2259  hypothetical protein  27.72 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06411  hypothetical protein  50 
 
 
124 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0565  protein of unknown function DUF1232  29.76 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000140761  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  40.91 
 
 
124 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  50 
 
 
121 aa  50.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06311  hypothetical protein  34.15 
 
 
121 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0012  hypothetical protein  32.93 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  39.39 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  37.68 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  39.13 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  28.89 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  45.65 
 
 
123 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1633  hypothetical protein  32.56 
 
 
148 aa  47  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.529644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  44.19 
 
 
182 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  38.24 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  42.42 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  26.73 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  37.68 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  40.68 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  40.43 
 
 
96 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  35.82 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  52.38 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  42.86 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  36.07 
 
 
121 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  38.46 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  28.05 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1268  helix-turn-helix domain-containing protein  36.76 
 
 
213 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129761  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  36.76 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  36.51 
 
 
386 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  32.14 
 
 
114 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0974  hypothetical protein  40 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4472  hypothetical protein  40 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.200573 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0901  hypothetical protein  40 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144584  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0721  hypothetical protein  40 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000923081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0772  hypothetical protein  40 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000133286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0720  hypothetical protein  40 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0244927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0707  hypothetical protein  40 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000547065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0864  hypothetical protein  40 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0809  hypothetical protein  40 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909763  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  32.98 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0905  hypothetical protein  40 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6700199999999999e-43 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  55.88 
 
 
89 aa  43.9  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0999  hypothetical protein  41.86 
 
 
129 aa  43.5  0.0009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.178423  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  37.93 
 
 
91 aa  43.5  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  36.84 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  47.62 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  51.06 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  47.5 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  38.96 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  36.59 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4172  hypothetical protein  37.68 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0445378  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  52.94 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0643  hypothetical protein  44 
 
 
191 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  36.14 
 
 
127 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  36.14 
 
 
127 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  47.37 
 
 
142 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  41.3 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0661  hypothetical protein  47.62 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  38.89 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  47.73 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  50 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  44.19 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  44.74 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  44.19 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  40.3 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  47.06 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  42.22 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  48.72 
 
 
132 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  48.78 
 
 
118 aa  40.4  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1826  hypothetical protein  50 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  38.1 
 
 
130 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0801  hypothetical protein  43.48 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0811  protein of unknown function DUF1232  33.73 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  38.1 
 
 
130 aa  40  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1536  hypothetical protein  24.44 
 
 
246 aa  40  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.902005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>