More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4590 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  100 
 
 
239 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  100 
 
 
239 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  100 
 
 
239 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  93.59 
 
 
236 aa  444  1e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  91.63 
 
 
238 aa  439  1e-122  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  90.95 
 
 
247 aa  433  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  77.97 
 
 
241 aa  373  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.07 
 
 
235 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.83 
 
 
240 aa  324  8e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.96 
 
 
244 aa  312  3e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  65.94 
 
 
235 aa  308  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  62.66 
 
 
233 aa  305  6e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  62.23 
 
 
233 aa  301  8e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.96 
 
 
242 aa  298  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  3.87016e-06 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.76 
 
 
243 aa  293  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.5 
 
 
239 aa  293  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  62.45 
 
 
239 aa  286  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  64.47 
 
 
234 aa  286  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.11 
 
 
236 aa  286  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.28 
 
 
236 aa  286  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  62.56 
 
 
239 aa  282  3e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  62.28 
 
 
234 aa  282  3e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  59.57 
 
 
406 aa  281  8e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  59.91 
 
 
236 aa  279  3e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  57.74 
 
 
243 aa  277  1e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  60.34 
 
 
238 aa  275  6e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.89 
 
 
273 aa  274  8e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.57 
 
 
241 aa  272  3e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  57.85 
 
 
252 aa  271  8e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.41 
 
 
237 aa  269  4e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  57.85 
 
 
248 aa  268  6e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.85 
 
 
231 aa  268  7e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  55.23 
 
 
246 aa  268  8e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  58.01 
 
 
246 aa  267  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  58.3 
 
 
271 aa  263  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  56.5 
 
 
236 aa  263  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  58.05 
 
 
239 aa  263  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  60 
 
 
229 aa  261  6e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  58.85 
 
 
233 aa  258  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  57.46 
 
 
239 aa  257  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.37 
 
 
236 aa  252  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  56.58 
 
 
229 aa  252  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  55.79 
 
 
270 aa  251  7e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.19 
 
 
242 aa  251  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  55.32 
 
 
237 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.39 
 
 
258 aa  246  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  55.31 
 
 
242 aa  246  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  56.44 
 
 
286 aa  243  1e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  56.64 
 
 
250 aa  242  4e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  59.19 
 
 
231 aa  241  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  56.5 
 
 
254 aa  239  3e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  56.5 
 
 
254 aa  239  3e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  56.5 
 
 
254 aa  239  3e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  57.08 
 
 
249 aa  239  3e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  51.72 
 
 
241 aa  238  5e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  53.98 
 
 
255 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.5 
 
 
243 aa  236  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.47 
 
 
246 aa  236  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  54.87 
 
 
251 aa  235  4e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.88 
 
 
230 aa  232  4e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  51.57 
 
 
246 aa  231  5e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.61 
 
 
233 aa  231  8e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.05 
 
 
252 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  55.51 
 
 
252 aa  230  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1823  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.97 
 
 
241 aa  227  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  49.33 
 
 
257 aa  225  5e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.76 
 
 
254 aa  221  5e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  50.42 
 
 
246 aa  220  1e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  51.11 
 
 
227 aa  219  2e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 
231 aa  218  9e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  51.11 
 
 
230 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  51.11 
 
 
230 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  51.11 
 
 
230 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 
231 aa  215  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 
229 aa  212  3e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.09 
 
 
244 aa  209  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  49.78 
 
 
230 aa  209  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.88235e-09  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 
224 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2095  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 
256 aa  207  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  46.35 
 
 
236 aa  206  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.68356e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.46 
 
 
224 aa  204  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 
228 aa  204  9e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 
228 aa  202  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 
224 aa  201  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 
225 aa  200  2e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  52.44 
 
 
229 aa  199  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0569  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 
248 aa  199  4e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 
239 aa  198  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 
224 aa  198  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  44.21 
 
 
239 aa  197  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 
224 aa  197  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  9.34276e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  44.21 
 
 
239 aa  197  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.89 
 
 
228 aa  197  1e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  44.21 
 
 
239 aa  196  2e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  44.21 
 
 
239 aa  196  2e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  44.21 
 
 
239 aa  196  2e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  44.21 
 
 
239 aa  196  2e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  44.21 
 
 
239 aa  196  2e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.73192e-15 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  44.21 
 
 
239 aa  196  2e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  44.21 
 
 
239 aa  196  2e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>