217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4358 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4358  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 339 aa  671    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4444  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 339 aa  671    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0599387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4738  DeoR family transcriptional regulator  98.23 
 
 		 339 aa  661    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 		 315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  30.53 
 
 		 315 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  30.53 
 
 		 315 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  30.53 
 
 		 315 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  30.53 
 
 		 315 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  30.53 
 
 		 315 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  30.53 
 
 		 315 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  30 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  30 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  30 
 
 		 316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  35.31 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  26.03 
 
 		 315 aa  126  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0409  DeoR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  31.63 
 
 		 323 aa  126  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  26.55 
 
 		 321 aa  125  9e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  31.25 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  30.86 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  29.45 
 
 		 694 aa  116  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 326 aa  115  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1366  DeoR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  30.09 
 
 		 700 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2217  sugar-binding domain-containing protein  33.23 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0880863 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1813  sugar-binding domain-containing protein  33.23 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2858  DeoR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.427449 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1923  DeoR family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2414  DeoR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415693  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2312  sugar-binding domain-containing protein  30.56 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  28.96 
 
 		 694 aa  114  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1160  citrate lyase regulator, putative  26.58 
 
 		 321 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152534  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0710  DeoR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0415966  normal  0.409033 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3705  transcriptional regulator, DeoR family  28.62 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0701  transcriptional regulator, putative  34.52 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  27.67 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4121  DeoR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  29.75 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  29.75 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  29.75 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0358  DeoR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1190  DeoR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0087  transcriptional regulator  28.97 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.284033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 312 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  29.75 
 
 		 317 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.853311 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  29.43 
 
 		 317 aa  106  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  27.63 
 
 		 315 aa  106  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  27.63 
 
 		 315 aa  106  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1045  putative transcriptional regulator  34.25 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0641  putative transcriptional regulator  34.25 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4152  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2476  putative transcriptional regulator  34.25 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.528896  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0883  putative transcriptional regulator  34.25 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300696  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0886  putative transcriptional regulator  34.25 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0089  putative transcriptional regulator  34.25 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.156043  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2395  transcriptional regulator, putative  30.03 
 
 		 317 aa  106  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129773  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3422  transcriptional regulator, DeoR family  31.17 
 
 		 331 aa  106  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00167672  hitchhiker  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0342  transcriptional regulator, putative  34.25 
 
 		 315 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03820  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  32.51 
 
 		 318 aa  105  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  28.08 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5326  transcriptional regulator, DeoR family  31.15 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.625003 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0947  sugar-binding domain-containing protein  28.31 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3417  DeoR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330791  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  29.19 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  27.33 
 
 		 315 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  27.76 
 
 		 310 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3284  sugar-binding domain-containing protein  28.35 
 
 		 319 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  27.44 
 
 		 310 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2041  DeoR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0455  HTH-type transcriptional regulator  26.38 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0561  transcriptional regulator, DeoR family  31.68 
 
 		 322 aa  102  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2573  putative sugar-binding region  27.54 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  27.76 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  27.13 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2702  DeoR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 341 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  27.44 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  27.13 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0904  sugar-binding domain-containing protein  26.91 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  33.44 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3245  sugar-binding domain-containing protein  26.91 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  27.44 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2635  DeoR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1988  transcriptional regulator, DeoR family  28.39 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000190118 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1071  transcriptional regulator, DeoR family  22.96 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0743327  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2127  putative transcriptional regulator (repressor) transcription regulator protein  33.54 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2506  DeoR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140537  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2524  DeoR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 357 aa  99.8  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  29.23 
 
 		 320 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2359  DeoR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 317 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2643  transcriptional regulator, DeoR family  26.81 
 
 		 314 aa  99.8  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000047791  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3378  DeoR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 314 aa  99.8  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  27.44 
 
 		 362 aa  99.4  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3426  transcriptional regulator, DeoR family  32.21 
 
 		 336 aa  99  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000128102  hitchhiker  0.000369774 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 320 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>