14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4251 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4251  putative lipoprotein  100 
 
 
219 aa  447  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.574926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4337  putative lipoprotein  100 
 
 
219 aa  447  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.47243  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4630  putative lipoprotein  100 
 
 
219 aa  447  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368951  normal  0.388459 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4785  putative lipoprotein  63.32 
 
 
223 aa  266  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.860651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1941  putative lipoprotein  58.38 
 
 
217 aa  246  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.946468  normal  0.897742 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11034  lipoprotein lpqT  57.07 
 
 
226 aa  244  6e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10039  secreted proline rich protein mtc28 (proline rich 28 kDa antigen)  36.36 
 
 
310 aa  94  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.768071 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5390  hypothetical protein  32.54 
 
 
297 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5479  hypothetical protein  32.54 
 
 
297 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.846329  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5766  hypothetical protein  32.54 
 
 
297 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555782  normal  0.844624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6055  hypothetical protein  31.76 
 
 
320 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342819  normal  0.445072 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0852  hypothetical protein  32.35 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0559953 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0313  Lipoprotein LpqT, predicted  29.52 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.621091  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0519  Lipoprotein LpqT, predicted  29.05 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>