40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4148 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_4223  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  607  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4148  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  607  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4379  hypothetical protein  99.56 
 
 		 229 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.050134  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4673  hypothetical protein  65 
 
 		 323 aa  294  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2044  integral membrane protein-like protein  49.34 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00652767  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3258  hypothetical protein  39.18 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12581  hypothetical protein  44.16 
 
 		 325 aa  159  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.713228  normal  0.93141 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0962  integral membrane protein-like protein  36.11 
 
 		 250 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.765265  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2212  hypothetical protein  36.21 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32045  normal  0.0285303 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2197  hypothetical protein  33.33 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481284  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  29.96 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1552  integral putative membrane protein  31.06 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0661  hypothetical protein  29.61 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1746  integral membrane protein  27.05 
 
 		 452 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.415451  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13380  predicted integral membrane protein  33.78 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271933  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  26.79 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2431  hypothetical protein  24.26 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.297955  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  43.81 
 
 		 1821 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  26.95 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  42.27 
 
 		 1079 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0029  FHA domain-containing protein  55.88 
 
 		 470 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1900  hypothetical protein  31.73 
 
 		 226 aa  54.3  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2073  hypothetical protein  29.69 
 
 		 218 aa  54.3  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000612499  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  42.11 
 
 		 3322 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2146  hypothetical protein  29.51 
 
 		 218 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00523759  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0383  hypothetical protein  24.89 
 
 		 228 aa  50.4  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07940  hypothetical protein  37.8 
 
 		 245 aa  50.1  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.267226  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1249  hypothetical protein  33.62 
 
 		 195 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000710568  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  36.99 
 
 		 2272 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  36.99 
 
 		 2179 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02743  Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A (eIF3a)(Eukaryotic translation initiation factor 3 110 kDa subunit homolog)(eIF3 p110)(Translation initiation factor eIF3, p110 subunit homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9N7]  38.46 
 
 		 1035 aa  45.8  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.224701 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  42.67 
 
 		 2914 aa  45.4  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0854  hypothetical protein  47.5 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0320102  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5225  putative transmembrane protein  25.86 
 
 		 398 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4946  putative transmembrane protein  25.86 
 
 		 398 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4857  putative transmembrane protein  25.86 
 
 		 398 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2088  hypothetical protein  25.83 
 
 		 259 aa  43.5  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0013541  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1349  hypothetical protein  24.84 
 
 		 248 aa  42.7  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0270376 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04719  conserved hypothetical protein similar to Rho guanine nucleotide exchange factor (Eurofung)  34.94 
 
 		 1199 aa  42.7  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2434  hypothetical protein  32.99 
 
 		 225 aa  42.4  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.30947  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>