291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4118 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4349  hypothetical protein  98.75 
 
 		 400 aa  774    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4118  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  782    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00655828  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4193  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  782    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.662681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11122  hypothetical protein  61.54 
 
 		 385 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4645  hypothetical protein  56.3 
 
 		 396 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2069  hypothetical protein  56.38 
 
 		 391 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0264155 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  28.31 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  29.26 
 
 		 384 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  29.66 
 
 		 365 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  27.83 
 
 		 389 aa  106  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  27.76 
 
 		 356 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  27.83 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  26.16 
 
 		 361 aa  104  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  26.36 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  28.82 
 
 		 371 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  28.09 
 
 		 353 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  26.59 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  28.23 
 
 		 346 aa  102  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  27.78 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  25.42 
 
 		 387 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  28.24 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  26.23 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  26.69 
 
 		 415 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  26.1 
 
 		 369 aa  99.4  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  27.22 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  27.83 
 
 		 365 aa  98.6  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  28.02 
 
 		 354 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  27.67 
 
 		 398 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  27.67 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  28.02 
 
 		 354 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  27.22 
 
 		 356 aa  95.5  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  27.67 
 
 		 353 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  25.37 
 
 		 365 aa  94.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 379 aa  94.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  26.87 
 
 		 374 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  28.69 
 
 		 355 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  25 
 
 		 394 aa  93.6  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  26.67 
 
 		 361 aa  93.2  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  26.48 
 
 		 359 aa  92.8  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  28.69 
 
 		 355 aa  93.2  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  26.87 
 
 		 352 aa  92.8  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  26.87 
 
 		 352 aa  92.8  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  26.74 
 
 		 354 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  26.87 
 
 		 352 aa  92.8  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  26.87 
 
 		 352 aa  92.8  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  26.87 
 
 		 352 aa  92.8  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  26.87 
 
 		 352 aa  92.8  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  25.98 
 
 		 363 aa  92.4  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  24.61 
 
 		 339 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  26.87 
 
 		 352 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  26.84 
 
 		 345 aa  92.4  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2181  protein of unknown function UPF0118  26.98 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00612132  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  24.06 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  27.83 
 
 		 362 aa  91.3  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  26.97 
 
 		 362 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  26.96 
 
 		 363 aa  89.7  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  27.53 
 
 		 352 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  31.46 
 
 		 353 aa  89.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  25.7 
 
 		 360 aa  89.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  27.64 
 
 		 363 aa  89.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  25.15 
 
 		 354 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  26.55 
 
 		 354 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13258  putative transmembrane protein  24.41 
 
 		 339 aa  87.4  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  26.79 
 
 		 349 aa  86.7  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  24.65 
 
 		 362 aa  86.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  26.58 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  25.37 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  23.85 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03420  hypothetical protein  25.53 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  24.02 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  25.08 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  24.93 
 
 		 352 aa  82.8  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  27.19 
 
 		 351 aa  82.8  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  25.07 
 
 		 358 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  30.46 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  27.19 
 
 		 351 aa  82.8  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  26.12 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  28.96 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2369  hypothetical protein  26.23 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00120754  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0738  acid membrane antigen A  24 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.444287  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  28.34 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  26.01 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  26.02 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  27.13 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  28.65 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1732  protein of unknown function UPF0118  25.39 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000390095  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  29.81 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  21.82 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  19.53 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  29.34 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  24.37 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0228  hypothetical protein  25.44 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  27.43 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  26.01 
 
 		 367 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0336  hypothetical protein  24.57 
 
 		 372 aa  72  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000639163  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  29.88 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  27.53 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  27.53 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  23.62 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  28.05 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>