More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3862 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3862  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 299 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3848  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 299 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3936  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 299 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2342  thioredoxin domain-containing protein  76.25 
 
 		 298 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299917  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4303  thioredoxin domain-containing protein  77.26 
 
 		 297 aa  394  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408854  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11356  thioredoxin  70.07 
 
 		 304 aa  382  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  46.07 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  47.69 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6079  thioredoxin domain protein  49.07 
 
 		 326 aa  215  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1268  Thioredoxin domain protein  45.49 
 
 		 323 aa  195  8.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  43.17 
 
 		 311 aa  182  8.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  37.58 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1704  thioredoxin domain protein  38 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  43.62 
 
 		 321 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  40.96 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  40.54 
 
 		 300 aa  166  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  40.48 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  41.52 
 
 		 312 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2594  thioredoxin domain-containing protein  34.64 
 
 		 339 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.238157  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0921  thioredoxin domain-containing protein  35.5 
 
 		 301 aa  149  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.460441 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1092  Thioredoxin domain protein  39.86 
 
 		 310 aa  149  8e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.509026  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  34.57 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2327  thioredoxin domain protein  34.38 
 
 		 334 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128937 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1730  putative thioredoxin domain-containing protein  37.09 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  37.75 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  38.01 
 
 		 329 aa  132  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2422  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.67 
 
 		 319 aa  125  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10300  thioredoxin domain-containing protein  37.62 
 
 		 313 aa  125  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09500  thioredoxin domain-containing protein  34.81 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.460116  normal  0.88242 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1804  thioredoxin domain-containing protein  36.57 
 
 		 314 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0364  putative thioredoxin  35.24 
 
 		 320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  28.9 
 
 		 330 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  28.14 
 
 		 334 aa  115  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1117  thioredoxin-related protein  33.66 
 
 		 324 aa  112  8.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0139  hypothetical protein  29.47 
 
 		 340 aa  109  5e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  28.62 
 
 		 302 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  30.72 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  31.54 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  33 
 
 		 289 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1282  Thioredoxin domain  35.48 
 
 		 319 aa  105  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00790933  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  31.18 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  25.93 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  29.59 
 
 		 302 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  31.65 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  31.43 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  31.54 
 
 		 310 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08240  thioredoxin domain-containing protein  32.95 
 
 		 324 aa  102  7e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19060  thioredoxin domain-containing protein  33 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.595284  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  27.99 
 
 		 293 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  32.43 
 
 		 289 aa  99  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  23.39 
 
 		 324 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  29.58 
 
 		 306 aa  97.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  27.57 
 
 		 304 aa  96.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  28.47 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  28.07 
 
 		 290 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  27.94 
 
 		 306 aa  95.9  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  29.17 
 
 		 290 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  27.49 
 
 		 302 aa  95.5  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  27.72 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  28.42 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  26.58 
 
 		 304 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  29.01 
 
 		 289 aa  93.2  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  29.01 
 
 		 289 aa  93.2  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  30.33 
 
 		 282 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  29.01 
 
 		 289 aa  93.2  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  27.8 
 
 		 317 aa  92.8  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  41.9 
 
 		 282 aa  92.4  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  28.33 
 
 		 312 aa  92.4  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  33.45 
 
 		 282 aa  92.4  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  26.58 
 
 		 304 aa  92.4  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  27.02 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  30.74 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  29.23 
 
 		 290 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  30.23 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  29.77 
 
 		 282 aa  89.7  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  30.33 
 
 		 282 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  30.33 
 
 		 282 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  28.43 
 
 		 304 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  28.38 
 
 		 311 aa  89.4  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  29.68 
 
 		 274 aa  89  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  30.11 
 
 		 290 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  27.02 
 
 		 287 aa  87.4  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  27.18 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  30.22 
 
 		 918 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  28.86 
 
 		 282 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  28.86 
 
 		 282 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  28.62 
 
 		 291 aa  86.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3098  thioredoxin  38.58 
 
 		 333 aa  86.3  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032408  hitchhiker  0.0000022841 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  38.83 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  41.9 
 
 		 286 aa  85.9  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  29.33 
 
 		 282 aa  85.9  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  27.52 
 
 		 303 aa  85.9  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  27.53 
 
 		 329 aa  85.9  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2392  putative thioredoxin  35.97 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  37.14 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  28.72 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  28.07 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  31.36 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0966  thioredoxin domain-containing protein  35.42 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  27.53 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>