More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3824 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  100 
 
 
318 aa  643    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  100 
 
 
318 aa  643    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  100 
 
 
318 aa  643    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  92.77 
 
 
318 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  92.14 
 
 
318 aa  599  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  76.1 
 
 
318 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  56.05 
 
 
318 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  52.55 
 
 
318 aa  350  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  53.65 
 
 
317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  52.38 
 
 
317 aa  325  7e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  52.23 
 
 
318 aa  315  6e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  52.23 
 
 
318 aa  315  6e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  52.23 
 
 
318 aa  315  6e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  43.85 
 
 
309 aa  216  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.34 
 
 
302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  37.22 
 
 
311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  42.09 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4934  luciferase-like protein  38.05 
 
 
309 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.49 
 
 
298 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5022  luciferase family protein  38.05 
 
 
309 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125832  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5315  luciferase family protein  38.05 
 
 
309 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  39.93 
 
 
301 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3260  luciferase family protein  37.46 
 
 
304 aa  176  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7087  luciferase family protein  38.99 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  42.21 
 
 
283 aa  172  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3238  luciferase family protein  36.51 
 
 
304 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0148661  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1261  luciferase family protein  35.42 
 
 
300 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  38.22 
 
 
301 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2758  Luciferase-like monooxygenase  38.26 
 
 
296 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  31.61 
 
 
309 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0517  luciferase family protein  37.62 
 
 
304 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  33.33 
 
 
306 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  31.3 
 
 
329 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0705  hypothetical protein  42.96 
 
 
143 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  27.13 
 
 
360 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.2 
 
 
333 aa  96.7  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  23.05 
 
 
321 aa  92.4  8e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  30.07 
 
 
359 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.16 
 
 
332 aa  90.9  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.89 
 
 
336 aa  90.5  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  32.68 
 
 
314 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.64 
 
 
328 aa  89.7  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.57 
 
 
318 aa  89.4  7e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  31.28 
 
 
372 aa  88.6  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0203  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  31.15 
 
 
320 aa  87.8  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.68 
 
 
320 aa  88.2  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  29.72 
 
 
339 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  28.17 
 
 
327 aa  86.3  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.37 
 
 
339 aa  85.9  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  28.96 
 
 
341 aa  85.9  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  29.79 
 
 
348 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  27.39 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  29.15 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  28.61 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.76 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  28.18 
 
 
345 aa  82.4  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  27.31 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  26.63 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.66 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  31.58 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  27.37 
 
 
350 aa  79.3  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  32.35 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.12 
 
 
327 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.6 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6536  hypothetical protein  29.13 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  32.38 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  28.63 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  30.26 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  30.81 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  31.77 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.34 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  26.18 
 
 
346 aa  75.9  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  25.6 
 
 
349 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  30.61 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  28.84 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  29.74 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  25.63 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  29.87 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  30.61 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  30.86 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  22.83 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  30.86 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  30.29 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  31.38 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  30.1 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  23.83 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  26.58 
 
 
339 aa  73.2  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  23.83 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  28.16 
 
 
349 aa  72.8  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  23.83 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  27.32 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  26.33 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  25.1 
 
 
337 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  29.8 
 
 
352 aa  72.8  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  25 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  30.88 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  27.75 
 
 
346 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.82 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.24 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  26.76 
 
 
355 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>