159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3769 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3769  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
235 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.396044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3842  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
235 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3781  TetR family transcriptional regulator  99.57 
 
 
235 aa  474  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4236  TetR family transcriptional regulator  79.22 
 
 
236 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502121  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2416  TetR family transcriptional regulator  77.68 
 
 
247 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00485209  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7072  putative transcriptional regulator, TetR family  67.14 
 
 
216 aa  292  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22730  transcriptional regulator, TetR family  58.6 
 
 
216 aa  259  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3489  transcriptional regulator, TetR family  57.94 
 
 
230 aa  246  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1506  TetR family transcriptional regulator  59.07 
 
 
227 aa  245  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212096  hitchhiker  0.000526239 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1790  transcriptional regulator, TetR family  56.6 
 
 
224 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121253  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2597  transcriptional regulator, TetR family  55.76 
 
 
218 aa  245  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127933  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2891  transcriptional regulator, TetR family  58.94 
 
 
236 aa  236  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2889  transcriptional regulator, TetR family  54.29 
 
 
227 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3894  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
223 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0466911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5743  regulatory protein TetR  40.56 
 
 
208 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405607  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3285  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
270 aa  79  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2515  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00143422  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4057  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3897  regulatory protein, TetR  30.68 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0396363  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4548  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
247 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225011  normal  0.280375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1768  regulatory protein, TetR  31.55 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2468  TetR family transcriptional regulator  38.51 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3522  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
222 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0301  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 
250 aa  63.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.593617  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
229 aa  61.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1888  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 
224 aa  60.1  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3294  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 
255 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 
207 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0521  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
221 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.769368  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6888  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
254 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0223  regulatory protein TetR  35.96 
 
 
234 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.029073 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
238 aa  55.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  54.9 
 
 
221 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2515  regulatory protein, TetR  34.07 
 
 
288 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.977555  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
205 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
317 aa  53.1  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 
221 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
227 aa  53.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  29.22 
 
 
207 aa  53.1  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
234 aa  52.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  54.9 
 
 
220 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
213 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
223 aa  52.4  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
272 aa  52  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
273 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  44.78 
 
 
191 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  31.54 
 
 
210 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 
242 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
224 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  31.54 
 
 
210 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  53.7 
 
 
242 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
273 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
208 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
242 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
273 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 
244 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
273 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
235 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 
212 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
235 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
235 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  45.16 
 
 
233 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
220 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  33.68 
 
 
227 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
212 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
235 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
235 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  45.16 
 
 
233 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
212 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
235 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
212 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
318 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
316 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
318 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
318 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
316 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
316 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
318 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1732  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 
206 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
212 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
212 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
212 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5753  hypothetical protein  36.11 
 
 
259 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
222 aa  49.3  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
239 aa  48.9  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  40.28 
 
 
205 aa  48.9  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  50.94 
 
 
214 aa  49.3  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 
235 aa  48.9  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  41.11 
 
 
195 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
272 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
276 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal 
 
 
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NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  32.41 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
290 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal 
 
 
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