More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3758 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11456  acyl-CoA synthetase  72.81 
 
 		 535 aa  773    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0248769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  79.36 
 
 		 535 aa  856    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4127  acyl-CoA synthetase  72.69 
 
 		 540 aa  793    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  99.82 
 
 		 548 aa  1097    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 548 aa  1098    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 548 aa  1098    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0232  acyl-CoA synthetase  70.93 
 
 		 544 aa  758    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253384  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  79.02 
 
 		 530 aa  845    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0435  acyl-CoA synthetase  68.7 
 
 		 544 aa  734    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3854  AMP-dependent synthetase and ligase  57.69 
 
 		 550 aa  555  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  50.95 
 
 		 532 aa  494  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1995  AMP-dependent synthetase and ligase  47.97 
 
 		 541 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  47.34 
 
 		 539 aa  444  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  43.48 
 
 		 560 aa  423  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  45.11 
 
 		 569 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0051  AMP-dependent synthetase and ligase  44 
 
 		 546 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  44.71 
 
 		 564 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  44.61 
 
 		 534 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734432  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4678  AMP-dependent synthetase and ligase  45.25 
 
 		 539 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  45.22 
 
 		 577 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  45.49 
 
 		 542 aa  404  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00517119  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  45.22 
 
 		 577 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  45.22 
 
 		 574 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  46.31 
 
 		 527 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1993  acyl-CoA synthetase  44.11 
 
 		 550 aa  393  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  43.07 
 
 		 541 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4103  AMP-dependent synthetase and ligase  43.31 
 
 		 545 aa  384  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4630  AMP-dependent synthetase and ligase  44.03 
 
 		 544 aa  383  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4816  AMP-dependent synthetase and ligase  42.2 
 
 		 562 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2344  acyl-CoA synthetase  41.3 
 
 		 531 aa  332  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657578  decreased coverage  0.0026015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  38.62 
 
 		 560 aa  323  5e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1257  AMP-dependent synthetase and ligase  29.83 
 
 		 518 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 		 510 aa  252  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  34.39 
 
 		 492 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.44 
 
 		 500 aa  249  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.73 
 
 		 499 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.22 
 
 		 543 aa  243  9e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 		 552 aa  242  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 524 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 		 501 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 		 508 aa  236  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.73 
 
 		 509 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 532 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.67 
 
 		 514 aa  233  9e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 		 546 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0001  AMP-dependent synthetase and ligase  29.65 
 
 		 516 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.743652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 		 492 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  32.85 
 
 		 487 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  32.95 
 
 		 555 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  31.66 
 
 		 512 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  32.2 
 
 		 515 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4921  acyl-CoA synthetase  31.65 
 
 		 531 aa  220  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  32.2 
 
 		 515 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  32.2 
 
 		 515 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6898  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 		 536 aa  217  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.16 
 
 		 516 aa  217  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  31.08 
 
 		 523 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.62 
 
 		 509 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0928  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 		 553 aa  214  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  32.74 
 
 		 545 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 		 511 aa  214  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  30.92 
 
 		 662 aa  214  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  32.15 
 
 		 520 aa  213  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 518 aa  213  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 		 523 aa  213  7.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 		 518 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  31.39 
 
 		 519 aa  213  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 		 527 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.74 
 
 		 521 aa  212  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.58 
 
 		 513 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  30.27 
 
 		 544 aa  211  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  30.39 
 
 		 532 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 524 aa  212  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.12 
 
 		 513 aa  211  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  33.08 
 
 		 527 aa  211  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.95 
 
 		 486 aa  210  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5669  acyl-CoA synthetase  31.2 
 
 		 529 aa  209  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 		 505 aa  209  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  28.09 
 
 		 514 aa  209  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.38 
 
 		 503 aa  208  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1821  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 		 550 aa  208  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0662  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 		 548 aa  207  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.27921  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 509 aa  207  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0848  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 		 517 aa  207  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  30.96 
 
 		 518 aa  207  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 514 aa  206  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  29.82 
 
 		 512 aa  206  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 		 525 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.46 
 
 		 512 aa  206  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  32.6 
 
 		 508 aa  206  9e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.33 
 
 		 497 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2710  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 		 507 aa  206  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0406608  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.8 
 
 		 517 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.8 
 
 		 517 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  30.58 
 
 		 507 aa  206  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.8 
 
 		 517 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.33 
 
 		 497 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  31.12 
 
 		 516 aa  205  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.99 
 
 		 498 aa  204  3e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 555 aa  204  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>