281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3749 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  90.15 
 
 
411 aa  729    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  100 
 
 
408 aa  817    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  100 
 
 
408 aa  817    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  91.44 
 
 
412 aa  746    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  100 
 
 
408 aa  817    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  76.12 
 
 
402 aa  602  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  68.73 
 
 
403 aa  558  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  68.81 
 
 
404 aa  546  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  62.99 
 
 
419 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  58.85 
 
 
402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  56.66 
 
 
429 aa  451  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  57.11 
 
 
414 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  59.31 
 
 
417 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  59.31 
 
 
417 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  59.31 
 
 
417 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  59.21 
 
 
421 aa  444  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  58.23 
 
 
424 aa  437  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  40.2 
 
 
430 aa  281  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  43.51 
 
 
405 aa  275  7e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  39.36 
 
 
441 aa  266  7e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  40.66 
 
 
440 aa  265  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  39.17 
 
 
426 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  39.66 
 
 
431 aa  264  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  37.65 
 
 
431 aa  255  8e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  39.28 
 
 
423 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  39.95 
 
 
426 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  39.75 
 
 
445 aa  249  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  40.64 
 
 
430 aa  245  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  41.65 
 
 
438 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  38.89 
 
 
426 aa  237  3e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  38.1 
 
 
444 aa  237  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  39.33 
 
 
433 aa  233  6e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  40.64 
 
 
455 aa  232  8.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  38.08 
 
 
421 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  39.43 
 
 
444 aa  229  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  38.01 
 
 
459 aa  227  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  37.53 
 
 
437 aa  220  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  38.87 
 
 
433 aa  219  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  39.86 
 
 
444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  37.35 
 
 
433 aa  215  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  39.08 
 
 
407 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  34.74 
 
 
428 aa  208  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  36.66 
 
 
434 aa  205  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  34.39 
 
 
428 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  38.12 
 
 
432 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  35.56 
 
 
416 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  35.27 
 
 
422 aa  197  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  35.88 
 
 
407 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  35.06 
 
 
419 aa  193  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  37.07 
 
 
423 aa  193  6e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  35.19 
 
 
426 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  33.6 
 
 
407 aa  190  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  34.73 
 
 
401 aa  189  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  34.27 
 
 
419 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  33.33 
 
 
420 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  35.52 
 
 
432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  34.99 
 
 
417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  30.17 
 
 
413 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  36.83 
 
 
480 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  32.86 
 
 
413 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  35.35 
 
 
391 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  32.7 
 
 
405 aa  179  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  32.58 
 
 
409 aa  179  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  33.15 
 
 
400 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  34.04 
 
 
431 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  35.18 
 
 
423 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  32.86 
 
 
413 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  32.86 
 
 
413 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  33.96 
 
 
421 aa  176  8e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  34.68 
 
 
425 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  34.84 
 
 
396 aa  173  5e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  33.67 
 
 
470 aa  173  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  33.49 
 
 
436 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  32.92 
 
 
415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  34.41 
 
 
409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  33.5 
 
 
390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  32.86 
 
 
408 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  33.33 
 
 
412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  32.4 
 
 
418 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  32.76 
 
 
413 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  36.34 
 
 
426 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  34.01 
 
 
414 aa  160  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  33.43 
 
 
410 aa  160  5e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  34.08 
 
 
415 aa  160  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  37.27 
 
 
425 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  32.89 
 
 
405 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  31.47 
 
 
428 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  34.52 
 
 
409 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  34.52 
 
 
409 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  34.52 
 
 
409 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  36.74 
 
 
408 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  31.42 
 
 
391 aa  153  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  31.67 
 
 
461 aa  153  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  31.74 
 
 
445 aa  153  7e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  30.9 
 
 
432 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  31.65 
 
 
478 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  32.58 
 
 
461 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  31.87 
 
 
434 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  31.73 
 
 
407 aa  149  6e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6603  amidohydrolase  32.99 
 
 
423 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18808  normal  0.171207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>