299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3715 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  80.15 
 
 
429 aa  677    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  100 
 
 
417 aa  840    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  100 
 
 
417 aa  840    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  92.44 
 
 
424 aa  733    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  79.9 
 
 
414 aa  672    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  100 
 
 
417 aa  840    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  91.53 
 
 
421 aa  734    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  83.25 
 
 
402 aa  662    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  74.82 
 
 
419 aa  604  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  59.8 
 
 
412 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  59.27 
 
 
411 aa  462  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  61.04 
 
 
402 aa  455  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  59.56 
 
 
408 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  59.56 
 
 
408 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  59.56 
 
 
408 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  54.81 
 
 
403 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  54.57 
 
 
404 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  41.67 
 
 
405 aa  271  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  41.59 
 
 
431 aa  266  5e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  40.48 
 
 
430 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  41.26 
 
 
426 aa  261  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  40.14 
 
 
441 aa  260  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  39.86 
 
 
430 aa  259  8e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  39.9 
 
 
440 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  39.28 
 
 
445 aa  251  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  40.19 
 
 
444 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  38.13 
 
 
426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  39.2 
 
 
426 aa  239  9e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  36.28 
 
 
431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  38.68 
 
 
433 aa  229  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  36.23 
 
 
421 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  37.19 
 
 
444 aa  222  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  37.84 
 
 
438 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  39.86 
 
 
444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  36.08 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  37.47 
 
 
455 aa  220  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  37.41 
 
 
459 aa  216  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  36.89 
 
 
426 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  36.57 
 
 
437 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  37.53 
 
 
433 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  35.68 
 
 
434 aa  213  7e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  37.59 
 
 
433 aa  212  7.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  35.28 
 
 
428 aa  212  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  35.68 
 
 
432 aa  200  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  35.56 
 
 
407 aa  197  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  34.66 
 
 
421 aa  196  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  37.8 
 
 
423 aa  196  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  34.39 
 
 
422 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  32.74 
 
 
407 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  36.45 
 
 
423 aa  188  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  34.43 
 
 
407 aa  188  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  33.73 
 
 
425 aa  182  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  32.27 
 
 
428 aa  180  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  32.75 
 
 
470 aa  176  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  34.7 
 
 
419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  33.42 
 
 
413 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  35.65 
 
 
426 aa  172  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  32.56 
 
 
413 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  31.58 
 
 
431 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  35.75 
 
 
480 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  32.56 
 
 
413 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  33.17 
 
 
411 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  33.64 
 
 
419 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  32.08 
 
 
420 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  29.26 
 
 
413 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  34.01 
 
 
432 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  31.04 
 
 
401 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  33.25 
 
 
407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  30.48 
 
 
409 aa  167  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  34.81 
 
 
412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  35.12 
 
 
417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  32.72 
 
 
436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  32.79 
 
 
482 aa  164  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  32.48 
 
 
434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  36.29 
 
 
409 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  36.04 
 
 
409 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  33.99 
 
 
413 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  36.04 
 
 
409 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  32.1 
 
 
478 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  32.16 
 
 
416 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  33.17 
 
 
415 aa  159  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  34.58 
 
 
396 aa  157  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  33.07 
 
 
414 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  35.13 
 
 
408 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  31.63 
 
 
461 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  33.33 
 
 
391 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  32.25 
 
 
486 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  33.02 
 
 
461 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  31.57 
 
 
447 aa  153  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  28.26 
 
 
412 aa  152  7e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  29.06 
 
 
412 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  32.35 
 
 
411 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  31.04 
 
 
445 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  33.61 
 
 
391 aa  151  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  32.41 
 
 
405 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  30.88 
 
 
408 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  31.54 
 
 
447 aa  150  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  33.16 
 
 
409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  28.91 
 
 
432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  30.38 
 
 
400 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>