More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3692 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  82.47 
 
 
548 aa  906    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  60.66 
 
 
541 aa  646    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  100 
 
 
550 aa  1122    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  99.27 
 
 
550 aa  1113    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  82.17 
 
 
548 aa  916    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  100 
 
 
550 aa  1122    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  49.87 
 
 
397 aa  359  8e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  49.48 
 
 
393 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  46.88 
 
 
395 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  49.36 
 
 
453 aa  326  8.000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  45.17 
 
 
396 aa  316  8e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  42.75 
 
 
396 aa  309  9e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  46.79 
 
 
389 aa  303  5.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  43.89 
 
 
394 aa  301  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  40 
 
 
385 aa  242  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  39.18 
 
 
390 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  36.99 
 
 
390 aa  210  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.04 
 
 
385 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  36.25 
 
 
394 aa  204  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  35.5 
 
 
390 aa  204  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.99 
 
 
387 aa  203  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  36.09 
 
 
381 aa  199  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  37.94 
 
 
394 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  35.73 
 
 
390 aa  194  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  36.13 
 
 
386 aa  192  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  36.07 
 
 
389 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.62 
 
 
378 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  36.39 
 
 
391 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  36.64 
 
 
385 aa  190  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  33.93 
 
 
392 aa  190  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  37.07 
 
 
385 aa  188  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  36.13 
 
 
385 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  37.63 
 
 
383 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  38.12 
 
 
388 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  39.62 
 
 
403 aa  185  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  33.99 
 
 
385 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  35.03 
 
 
385 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  36.79 
 
 
388 aa  184  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  34.9 
 
 
402 aa  183  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  35.19 
 
 
389 aa  183  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0617  DitF protein  33.77 
 
 
400 aa  183  9.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  36.39 
 
 
383 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  36.41 
 
 
395 aa  181  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  34.52 
 
 
390 aa  180  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  35.28 
 
 
385 aa  180  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  35.28 
 
 
385 aa  180  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  37.17 
 
 
402 aa  177  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  37.17 
 
 
402 aa  177  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  33.5 
 
 
388 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.64 
 
 
388 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.64 
 
 
388 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  39.01 
 
 
388 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  39.01 
 
 
388 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  39.01 
 
 
388 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  36.53 
 
 
390 aa  176  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  35.79 
 
 
383 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  33.33 
 
 
385 aa  175  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  39.01 
 
 
388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  37.61 
 
 
393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  39.01 
 
 
388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.91 
 
 
384 aa  173  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.46 
 
 
388 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  37.02 
 
 
382 aa  170  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  35.92 
 
 
390 aa  170  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  34.45 
 
 
383 aa  169  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  35.68 
 
 
389 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  36.05 
 
 
381 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  34.71 
 
 
383 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  36.26 
 
 
389 aa  166  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.52 
 
 
397 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.19 
 
 
388 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  33.67 
 
 
381 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  34.83 
 
 
381 aa  163  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.65 
 
 
388 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  33.87 
 
 
384 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  34.09 
 
 
389 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.16 
 
 
389 aa  159  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  30.33 
 
 
380 aa  151  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  40.33 
 
 
382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  30.26 
 
 
383 aa  147  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2367  hypothetical protein  34.01 
 
 
393 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351877  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  32.35 
 
 
386 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3254  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase  31.97 
 
 
394 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146846  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  33.51 
 
 
384 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  29.72 
 
 
392 aa  145  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  34.39 
 
 
389 aa  144  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  34.47 
 
 
389 aa  143  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  31.32 
 
 
396 aa  144  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.59 
 
 
360 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  33.24 
 
 
391 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  30.98 
 
 
379 aa  140  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  32.68 
 
 
382 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  30.53 
 
 
379 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  31.3 
 
 
389 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  32.5 
 
 
382 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  32.61 
 
 
382 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1335  hypothetical protein  30.85 
 
 
391 aa  137  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  40.32 
 
 
384 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.39 
 
 
380 aa  134  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  31.75 
 
 
382 aa  134  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>