61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3659 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_3732  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  280  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3659  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  280  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17734  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3672  hypothetical protein  92.2 
 
 		 141 aa  260  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2520  hypothetical protein  84.44 
 
 		 146 aa  239  7e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167569  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4138  hypothetical protein  83.7 
 
 		 146 aa  235  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.342554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3388  hypothetical protein  71.01 
 
 		 138 aa  203  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  54.14 
 
 		 143 aa  148  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4132  hypothetical protein  47.11 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479777  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3587  hypothetical protein  39.81 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3555  hypothetical protein  37.9 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3365  hypothetical protein  36 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.810777  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3014  hypothetical protein  32.87 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.764426  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3029  hypothetical protein  32.87 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.417482  normal  0.14022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3060  hypothetical protein  32.87 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2863  hypothetical protein  36 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  27.94 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  30.58 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3567  hypothetical protein  30.56 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  26.67 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8927  hypothetical protein  31.97 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  31.45 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1357  hypothetical protein  31.45 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  30 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  28.04 
 
 		 413 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  31.62 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  25.19 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  29.03 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  25.19 
 
 		 130 aa  52  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  23.33 
 
 		 178 aa  52  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  25.74 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11644  hypothetical protein  31.2 
 
 		 163 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.187499  normal  0.695339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4526  hypothetical protein  34.06 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0992548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  30.91 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1083  hypothetical protein  30.65 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0940  hypothetical protein  29.46 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17870  predicted nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  37 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.736361  normal  0.638502 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  27 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  25.56 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  30.77 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  28.23 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  29.06 
 
 		 576 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3624  hypothetical protein  31.3 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  28.57 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4111  hypothetical protein  34.11 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0961571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  25.93 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  28.12 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  28.16 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  30.33 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  50 
 
 		 311 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  28.12 
 
 		 315 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  36.84 
 
 		 324 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  27.68 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  26.57 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  26.21 
 
 		 319 aa  41.2  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2476  protein of unknown function DUF35  28.41 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  24.35 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  26.05 
 
 		 143 aa  40.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  33.93 
 
 		 317 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  27.5 
 
 		 550 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  27.5 
 
 		 550 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>