175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3640 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3640  oligoribonuclease  100 
 
 		 215 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00635145  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3713  oligoribonuclease  100 
 
 		 215 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3645  oligoribonuclease  100 
 
 		 215 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2543  oligoribonuclease  85.58 
 
 		 214 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4100  oligoribonuclease  83.72 
 
 		 214 aa  367  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0350683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12533  oligoribonuclease  77.67 
 
 		 215 aa  336  9.999999999999999e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1056  oligoribonuclease  74.74 
 
 		 208 aa  292  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0686541  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2012  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  75.13 
 
 		 194 aa  292  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1339  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  72.22 
 
 		 198 aa  291  6e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1017  oligoribonuclease  71.43 
 
 		 196 aa  290  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1782  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  71.57 
 
 		 212 aa  289  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00227296  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1126  oligoribonuclease  72.16 
 
 		 198 aa  289  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.499716  normal  0.391456 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28650  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  76.34 
 
 		 202 aa  285  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0552434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1466  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  69.95 
 
 		 225 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0564  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  58.96 
 
 		 216 aa  252  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.686303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1649  oligoribonuclease  64.29 
 
 		 269 aa  250  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.554791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2269  oligoribonuclease  62.9 
 
 		 213 aa  249  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1254  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  66.67 
 
 		 204 aa  248  5e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1425  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  65.97 
 
 		 191 aa  247  9e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7676  putative oligoribonuclease; K01175  63.21 
 
 		 200 aa  247  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1040  oligoribonuclease  60.1 
 
 		 250 aa  244  6e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5510  oligoribonuclease  64.67 
 
 		 210 aa  244  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2680  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  63.98 
 
 		 198 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1351  oligoribonuclease  54.63 
 
 		 222 aa  231  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24870  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  58.55 
 
 		 220 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.82834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2655  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  54.22 
 
 		 235 aa  229  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.785262 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3716  oligoribonuclease  58.59 
 
 		 206 aa  229  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.952269  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08840  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  60.31 
 
 		 223 aa  227  8e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0178877  normal  0.0713087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5970  oligoribonuclease  58.5 
 
 		 213 aa  217  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1083  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  59.34 
 
 		 212 aa  216  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00161655  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  55.5 
 
 		 634 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1343  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  57.53 
 
 		 229 aa  213  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.801458  hitchhiker  0.000880887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2435  oligoribonuclease  55.14 
 
 		 211 aa  209  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0500585  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0907  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  55.21 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.206307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2185  oligoribonuclease  53.4 
 
 		 208 aa  208  6e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000203098 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5181  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  53.37 
 
 		 187 aa  188  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09680  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  51.32 
 
 		 208 aa  188  7e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.508062  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2574  oligoribonuclease  52.6 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0942  oligoribonuclease  48.47 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1081  exonuclease  46.88 
 
 		 235 aa  176  2e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1900  oligoribonuclease  48.45 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1016  oligoribonuclease  49.74 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3335  oligoribonuclease  50.85 
 
 		 179 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.475979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0633  oligoribonuclease  48.02 
 
 		 184 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1552  oligoribonuclease  51.12 
 
 		 195 aa  170  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000145931  normal  0.275073 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0863  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  47.7 
 
 		 188 aa  170  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.859258  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1734  oligoribonuclease  50.56 
 
 		 195 aa  169  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0026371  normal  0.333729 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1473  oligoribonuclease  50.29 
 
 		 183 aa  168  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.777714  normal  0.355719 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2911  oligoribonuclease  51.74 
 
 		 191 aa  168  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2968  oligoribonuclease  49.19 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139128  normal  0.188792 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1276  oligoribonuclease  46.67 
 
 		 198 aa  168  6e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0268591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0811  oligoribonuclease  51.15 
 
 		 193 aa  168  6e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0543642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0907  oligoribonuclease  50.28 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0884  oligoribonuclease  48.98 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.373133 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0778  oligoribonuclease  50.56 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101637 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4192  oligoribonuclease  50.56 
 
 		 206 aa  165  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.872573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0813  oligoribonuclease  48.98 
 
 		 219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0525  oligoribonuclease  46.11 
 
 		 195 aa  164  9e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.214811  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1893  oligoribonuclease  49.14 
 
 		 193 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.53221  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1994  oligoribonuclease  48.82 
 
 		 182 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0106356  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1483  oligoribonuclease  49.42 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135513  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1959  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  46.45 
 
 		 194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.552747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2320  oligoribonuclease Orn  46.45 
 
 		 194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1839  oligoribonuclease  47.4 
 
 		 182 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1670  oligoribonuclease  48.35 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0392  oligoribonuclease  50 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.484174  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0958  oligoribonuclease  49.46 
 
 		 206 aa  161  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.8305 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0954  oligoribonuclease  49.46 
 
 		 206 aa  161  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2535  oligoribonuclease  50 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0225  oligoribonuclease  50.28 
 
 		 183 aa  161  7e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0254555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0908  oligoribonuclease  50 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2848  oligoribonuclease  50 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0239  oligoribonuclease  50 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0985  oligoribonuclease  49.12 
 
 		 187 aa  161  8.000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0341  oligoribonuclease  46.63 
 
 		 183 aa  161  8.000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.828352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2908  oligoribonuclease  50 
 
 		 201 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.4726  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0564  oligoribonuclease  45 
 
 		 178 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2958  oligoribonuclease  50 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2426  oligoribonuclease  47.4 
 
 		 190 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3287  oligoribonuclease  47.73 
 
 		 181 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.161862  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2225  oligoribonuclease  51.12 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0592  oligoribonuclease  47.16 
 
 		 181 aa  159  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1037  oligoribonuclease  48.17 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0599  oligoribonuclease  48.17 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.62121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1078  oligoribonuclease  48.17 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.783759  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0559  oligoribonuclease  48.28 
 
 		 181 aa  159  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.143761  normal  0.198605 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0790  oligoribonuclease  47.16 
 
 		 181 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1847  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  44.75 
 
 		 188 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0353601 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4950  oligoribonuclease  45 
 
 		 178 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0591  oligoribonuclease  47.16 
 
 		 181 aa  158  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.886614  hitchhiker  0.000123281 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3439  oligoribonuclease  47.16 
 
 		 181 aa  158  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704694  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00112  oligoribonuclease  46.55 
 
 		 181 aa  158  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5678  oligoribonuclease  47.98 
 
 		 181 aa  158  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000295119  normal  0.99134 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04032  oligoribonuclease  47.98 
 
 		 181 aa  158  7e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000706599  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3828  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  47.98 
 
 		 181 aa  158  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000318857  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3848  oligoribonuclease  47.98 
 
 		 181 aa  158  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000498222  hitchhiker  0.0000133205 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4633  oligoribonuclease  47.98 
 
 		 181 aa  158  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387491  normal  0.0592166 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4694  oligoribonuclease  47.98 
 
 		 181 aa  158  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.76072e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03994  hypothetical protein  47.98 
 
 		 181 aa  158  7e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000413347  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4403  oligoribonuclease  47.98 
 
 		 181 aa  158  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000656326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>