More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3472 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  36.71 
 
 
2232 aa  659    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2029  Beta-ketoacyl synthase  52.49 
 
 
1263 aa  962    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0480562  normal  0.193313 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  37.22 
 
 
1876 aa  908    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  43.62 
 
 
1835 aa  1210    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  33.52 
 
 
3508 aa  681    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  45.24 
 
 
1577 aa  650    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2690  beta-ketoacyl synthase  71.29 
 
 
1698 aa  2259    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.588409  normal  0.25936 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  42.65 
 
 
1806 aa  657    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  43.33 
 
 
1827 aa  650    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.6 
 
 
1874 aa  703    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.19 
 
 
1822 aa  682    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3611  Beta-ketoacyl synthase  50.8 
 
 
1832 aa  928    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.461901  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  44.67 
 
 
2162 aa  655    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  35.82 
 
 
2090 aa  638    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  32.33 
 
 
1939 aa  789    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  37.82 
 
 
2220 aa  653    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  41.59 
 
 
2225 aa  657    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  35.38 
 
 
1832 aa  723    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  47.37 
 
 
1580 aa  658    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  42.14 
 
 
2085 aa  666    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3472  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
1704 aa  3323    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  47.37 
 
 
1580 aa  658    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  42.14 
 
 
2085 aa  666    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3535  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
1704 aa  3323    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  43.11 
 
 
1805 aa  680    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  38.54 
 
 
1828 aa  980    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3852  beta-ketoacyl synthase  72.86 
 
 
1744 aa  2290    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.534518 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  47.5 
 
 
1580 aa  649    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  42.14 
 
 
2085 aa  665    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3485  beta-ketoacyl synthase  98.71 
 
 
1704 aa  3284    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19651  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  38.13 
 
 
1823 aa  895    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  33.56 
 
 
7279 aa  635  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  44.04 
 
 
1581 aa  627  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12954  multi-functional membrane-associated mycocerosic acid synthase mas  43.14 
 
 
2111 aa  625  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 
7110 aa  625  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  41.27 
 
 
2108 aa  619  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  41.92 
 
 
1537 aa  618  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  39.03 
 
 
1656 aa  613  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  34.22 
 
 
1789 aa  610  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  36.3 
 
 
2230 aa  608  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  41.54 
 
 
2101 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  44.91 
 
 
1812 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  36.34 
 
 
2333 aa  602  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  34.02 
 
 
3408 aa  600  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4853  Acyl transferase  45.35 
 
 
1819 aa  601  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  33.1 
 
 
3645 aa  601  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  33.24 
 
 
2277 aa  601  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  34.9 
 
 
3111 aa  600  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  43.62 
 
 
1822 aa  599  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8815  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  41.45 
 
 
2111 aa  598  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39915  normal  0.217366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 
5400 aa  593  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  40.59 
 
 
2126 aa  596  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  42.22 
 
 
1520 aa  591  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  39.55 
 
 
3101 aa  590  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  42.22 
 
 
1520 aa  591  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  33.44 
 
 
4080 aa  586  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  42.74 
 
 
1190 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  42.74 
 
 
1190 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  33.15 
 
 
7210 aa  583  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.86 
 
 
2136 aa  582  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  42.74 
 
 
1190 aa  582  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  41.34 
 
 
2188 aa  579  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  36.71 
 
 
2890 aa  578  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.16 
 
 
1804 aa  579  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0991  acyl transferase region  42.1 
 
 
1076 aa  575  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  34.87 
 
 
3463 aa  571  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  32.34 
 
 
3711 aa  571  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  37.54 
 
 
1587 aa  567  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  33.56 
 
 
1087 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
1816 aa  556  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  33.23 
 
 
1966 aa  558  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  34.9 
 
 
2108 aa  556  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  37.05 
 
 
1144 aa  555  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.83 
 
 
1909 aa  556  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  33.82 
 
 
5255 aa  553  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  34.78 
 
 
2107 aa  551  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  33.85 
 
 
3693 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  33.85 
 
 
3693 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  40.74 
 
 
3424 aa  544  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  33.83 
 
 
3702 aa  544  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  32.89 
 
 
2719 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  38.28 
 
 
3449 aa  542  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  39.09 
 
 
2966 aa  540  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  36.69 
 
 
3930 aa  540  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  34.5 
 
 
3676 aa  539  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.45 
 
 
1867 aa  537  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0175  Beta-ketoacyl synthase  37.37 
 
 
1704 aa  540  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  40.54 
 
 
3158 aa  536  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  41.21 
 
 
4607 aa  530  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  37.59 
 
 
2020 aa  532  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  33.83 
 
 
4183 aa  533  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  32.91 
 
 
3494 aa  525  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  40.79 
 
 
3427 aa  521  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  40.3 
 
 
3176 aa  521  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  38.65 
 
 
5154 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  33.64 
 
 
3679 aa  516  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2600  Beta-ketoacyl synthase  35.02 
 
 
2543 aa  516  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.39 
 
 
1337 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  37.18 
 
 
4151 aa  516  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  38.55 
 
 
1402 aa  514  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>