More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3454 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  100 
 
 
436 aa  859    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  77.01 
 
 
435 aa  665    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  100 
 
 
436 aa  859    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  86.68 
 
 
432 aa  707    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  100 
 
 
436 aa  859    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3830  CBS domain-containing protein  86.62 
 
 
432 aa  704    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2760  protein of unknown function DUF21  65.06 
 
 
437 aa  518  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.24757  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  66.1 
 
 
490 aa  521  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  58.01 
 
 
435 aa  448  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  55.58 
 
 
461 aa  443  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13600  CBS domain-containing protein  57.01 
 
 
457 aa  430  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  59.08 
 
 
537 aa  421  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4625  CBS domain-containing protein  56.68 
 
 
426 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373685  hitchhiker  0.00665585 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  52.56 
 
 
430 aa  402  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  55.45 
 
 
434 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  55.83 
 
 
425 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  55.8 
 
 
442 aa  386  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  55.53 
 
 
464 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  55.2 
 
 
464 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  52.76 
 
 
452 aa  376  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  52.94 
 
 
483 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1269  CBS  50.68 
 
 
454 aa  353  5e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2114  CBS domain-containing protein  51.84 
 
 
484 aa  345  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  46.64 
 
 
439 aa  333  3e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3385  CBS domain containing protein  49.39 
 
 
438 aa  322  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11750  CBS domain-containing protein  44.44 
 
 
495 aa  315  9.999999999999999e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.885708  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0709  CBS domain containing protein  45.21 
 
 
465 aa  307  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  44.44 
 
 
443 aa  283  5.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2230  CBS domain-containing protein  40.85 
 
 
447 aa  264  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00904717  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2204  CBS domain containing protein  43.4 
 
 
456 aa  258  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00693904 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13490  CBS domain-containing protein  41.81 
 
 
448 aa  245  9e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  0.0781314 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  34.38 
 
 
420 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17230  CBS domain-containing protein  37.05 
 
 
444 aa  226  6e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0117633  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0594  hemolysin-like protein  36.52 
 
 
477 aa  222  9e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  36.98 
 
 
447 aa  218  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  35.11 
 
 
439 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12320  CBS domain-containing protein  39.47 
 
 
441 aa  211  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.509948  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  35.51 
 
 
434 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2186  CBS domain containing protein  44.85 
 
 
476 aa  209  9e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  30.12 
 
 
429 aa  208  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0862  CBS domain protein  37.5 
 
 
499 aa  207  4e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  30.79 
 
 
467 aa  205  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  32.65 
 
 
421 aa  205  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  43.68 
 
 
284 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  36.11 
 
 
420 aa  201  3e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  29.07 
 
 
422 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  34.07 
 
 
435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  31.58 
 
 
425 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  34.12 
 
 
442 aa  196  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  31.58 
 
 
430 aa  196  9e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  36.22 
 
 
427 aa  195  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  30.98 
 
 
477 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  32.55 
 
 
443 aa  194  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  30.67 
 
 
447 aa  193  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  38.78 
 
 
445 aa  192  8e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  30 
 
 
429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  41.91 
 
 
291 aa  190  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  38.85 
 
 
421 aa  190  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  31.26 
 
 
470 aa  189  8e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  31.54 
 
 
437 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  42.28 
 
 
291 aa  188  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  31.38 
 
 
431 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0762  hypothetical protein  33.49 
 
 
456 aa  188  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0171545  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  42.28 
 
 
291 aa  187  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  42.28 
 
 
291 aa  187  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  42.28 
 
 
291 aa  186  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  42.28 
 
 
291 aa  186  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1410  protein of unknown function DUF21  31.59 
 
 
456 aa  186  7e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  31.43 
 
 
420 aa  186  7e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  30.69 
 
 
417 aa  186  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  41.22 
 
 
291 aa  186  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  40.82 
 
 
291 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  41.46 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  41.46 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  41.46 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  41.46 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  26.92 
 
 
414 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  28.93 
 
 
434 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  36.13 
 
 
444 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  33.68 
 
 
426 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  29.67 
 
 
432 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  37 
 
 
292 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  31.95 
 
 
434 aa  180  5.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  27.21 
 
 
443 aa  179  7e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  41.53 
 
 
292 aa  179  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  30.18 
 
 
448 aa  178  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  26.7 
 
 
455 aa  178  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  39.49 
 
 
292 aa  179  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  30.42 
 
 
442 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  30.42 
 
 
442 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  31.18 
 
 
446 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  41.83 
 
 
284 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  30.42 
 
 
442 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  30.42 
 
 
442 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
276 aa  178  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  29.48 
 
 
468 aa  178  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  30.52 
 
 
440 aa  177  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  30.19 
 
 
442 aa  176  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  30.27 
 
 
440 aa  176  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  30.83 
 
 
432 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>