More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3446 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
120 aa  231  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
120 aa  231  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
120 aa  231  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2718  regulatory protein, ArsR  75.42 
 
 
131 aa  164  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  70.34 
 
 
120 aa  155  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  74.34 
 
 
135 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  74.73 
 
 
133 aa  130  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  55.88 
 
 
139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  69.89 
 
 
124 aa  127  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  64.13 
 
 
101 aa  122  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  66.28 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  59.78 
 
 
103 aa  111  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  64.2 
 
 
84 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
125 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  34.62 
 
 
113 aa  73.6  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  36.79 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  33.04 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  33.04 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  43.18 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  38.3 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  38.68 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  47.14 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  38.3 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
106 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  37.96 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  38.1 
 
 
98 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
120 aa  63.5  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0116  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 
103 aa  63.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1723  transcriptional regulator  40.96 
 
 
95 aa  63.5  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000132397  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  35.85 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  30.91 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
126 aa  61.6  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 
121 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  34.74 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4161  ArsR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
172 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0906669  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  35.71 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 
130 aa  61.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4483  ArsR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
172 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  38.55 
 
 
110 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  32.38 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1776  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
113 aa  60.8  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
100 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0013  regulatory protein ArsR  38.37 
 
 
110 aa  60.8  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
98 aa  60.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  38.96 
 
 
108 aa  60.5  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 
109 aa  60.1  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  40.79 
 
 
92 aa  60.1  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  45.33 
 
 
98 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1719  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 
120 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  36.49 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4000  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
100 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4010  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
100 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3471  transcriptional regulator, ArsR family  45.12 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.199985 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  35.35 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  41.1 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  36.54 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  34.09 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4339  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4392  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  35.56 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0861  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4373  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4279  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4112  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  38.81 
 
 
107 aa  58.9  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  38.81 
 
 
107 aa  58.9  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>