253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3284 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  100 
 
 		 502 aa  997    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  100 
 
 		 492 aa  978    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  99.59 
 
 		 492 aa  976    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.26 
 
 		 486 aa  226  9e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  30.32 
 
 		 486 aa  192  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 516 aa  192  9e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  34.31 
 
 		 487 aa  190  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  31.3 
 
 		 512 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  31.46 
 
 		 515 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  25.31 
 
 		 478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.9 
 
 		 480 aa  111  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  26.76 
 
 		 519 aa  107  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.24 
 
 		 501 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  27.02 
 
 		 486 aa  103  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  27.08 
 
 		 504 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  26.25 
 
 		 505 aa  101  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  34.86 
 
 		 598 aa  98.2  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  28.88 
 
 		 543 aa  96.7  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 553 aa  95.9  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  20.34 
 
 		 537 aa  92.4  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  28.41 
 
 		 514 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 517 aa  89  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  27.38 
 
 		 510 aa  87.8  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  20.07 
 
 		 542 aa  86.7  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  33.93 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  29.65 
 
 		 558 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  20.61 
 
 		 555 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 563 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  27.8 
 
 		 518 aa  73.6  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  20.44 
 
 		 562 aa  73.6  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  30.91 
 
 		 485 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  30.54 
 
 		 481 aa  71.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  20.19 
 
 		 515 aa  71.2  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.69 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  23.35 
 
 		 493 aa  70.5  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 659 aa  69.3  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  24.64 
 
 		 558 aa  69.3  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  29.01 
 
 		 236 aa  69.3  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 586 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  40.54 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  25.68 
 
 		 535 aa  67  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 502 aa  67  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 305 aa  66.6  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  27.87 
 
 		 585 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  30.12 
 
 		 609 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  28 
 
 		 596 aa  65.1  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  32.21 
 
 		 705 aa  64.7  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  36.96 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.11 
 
 		 601 aa  64.3  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 535 aa  64.3  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  26.06 
 
 		 547 aa  63.5  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  38.06 
 
 		 501 aa  63.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  30.87 
 
 		 538 aa  63.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  26.19 
 
 		 575 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  32.23 
 
 		 520 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  41.56 
 
 		 525 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  46.67 
 
 		 515 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  25.69 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 546 aa  62  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 552 aa  62  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  26.63 
 
 		 536 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  41.56 
 
 		 525 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1111  hypothetical protein  33.1 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  24.1 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  31.73 
 
 		 557 aa  60.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  44 
 
 		 520 aa  60.1  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  30.09 
 
 		 442 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  35.77 
 
 		 616 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 564 aa  58.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  52.38 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1641  transcriptional regulator, CdaR  32.65 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  28.75 
 
 		 532 aa  58.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 537 aa  57.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  25.52 
 
 		 425 aa  57  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 494 aa  57  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  26.19 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  33.13 
 
 		 502 aa  56.6  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  37.9 
 
 		 454 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.65 
 
 		 459 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  42.25 
 
 		 549 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0407  transcriptional regulator, CdaR  34.07 
 
 		 520 aa  55.1  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  30.53 
 
 		 602 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 462 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  25.93 
 
 		 399 aa  54.7  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  29.12 
 
 		 411 aa  54.7  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  46.05 
 
 		 421 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 549 aa  54.3  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  30.51 
 
 		 528 aa  53.9  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  22.7 
 
 		 566 aa  53.9  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  26.79 
 
 		 542 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 542 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 542 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>