More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3239 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3239  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  100 
 
 		 220 aa  427  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3301  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  100 
 
 		 220 aa  427  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0147948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3250  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  99.55 
 
 		 220 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3504  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  82.73 
 
 		 221 aa  352  4e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3002  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  80.91 
 
 		 221 aa  346  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1040  response regulator receiver and unknown domain protein  54.75 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0598  response regulator receiver and unknown domain protein  49.32 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00972259 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37850  response regulator of citrate/malate metabolism  50 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1397  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  47.81 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8064  response regulator of citrate/malate metabolism  51.82 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3623  response regulator receiver and unknown domain protein  48.66 
 
 		 232 aa  177  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.796239  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1864  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  41.7 
 
 		 230 aa  171  7.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134891  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0514  response regulator receiver and unknown domain protein  42.34 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003320  transcriptional regulatory protein CitB  39.91 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02430  response regulator  40.83 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0473  response regulator receiver  39.56 
 
 		 230 aa  164  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0471  response regulator  40.45 
 
 		 230 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1209  response regulator  41.74 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000538312  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4743  response regulator  38.67 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0616  response regulator  40.45 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0508  response regulator receiver and unknown domain protein  47.47 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.957096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0689  response regulator  40 
 
 		 230 aa  161  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0596  response regulator  39.55 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0064  response regulator receiver and unknown domain protein  46.02 
 
 		 238 aa  159  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.803731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3706  response regulator receiver and unknown domain protein  46.19 
 
 		 226 aa  159  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1376  response regulator receiver and unknown domain protein  41.59 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0621  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 230 aa  158  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3992  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  40.64 
 
 		 231 aa  157  9e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000025564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3868  putative response regulator ofcitrate/malate metabolism  45.95 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.017891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5599  response regulator receiver and unknown domain protein  43.61 
 
 		 243 aa  155  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.532525 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2186  HTH-type transcriptional regulator, two-component response regulator  37.67 
 
 		 224 aa  155  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1163  response regulator receiver and unknown domain protein  40.37 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2788  response regulator receiver and unknown domain protein  38.29 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25720  response regulator of citrate/malate metabolism  43.64 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4644  response regulator receiver and unknown domain protein  36.89 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210142  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2442  response regulator receiver and unknown domain protein  42.53 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2899  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  41.7 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8199  response regulator receiver and unknown domain protein  43.67 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5078  response regulator receiver and unknown domain protein  44.34 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.763511 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0497  response regulator receiver  33.93 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2556  DNA-binding transcriptional activator DcuR  37.61 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1239  response regulator receiver and unknown domain protein  34.55 
 
 		 225 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0291668  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4101  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.56 
 
 		 240 aa  137  8.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1528  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  41.56 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0317  transcriptional regulator CitB  38.77 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2259  response regulator receiver and unknown domain protein  45.25 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00555688  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1958  DNA-binding transcriptional activator DcuR  38.22 
 
 		 237 aa  135  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0209132 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03995  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with DcuS  36.4 
 
 		 239 aa  134  8e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3868  response regulator receiver and unknown domain protein  36.4 
 
 		 239 aa  134  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4678  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.4 
 
 		 239 aa  134  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4591  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.4 
 
 		 239 aa  134  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03956  hypothetical protein  36.4 
 
 		 239 aa  134  8e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4558  DNA-binding transcriptional activator DcuR  37.61 
 
 		 239 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4365  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.4 
 
 		 239 aa  134  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.414132  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5638  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.4 
 
 		 239 aa  134  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3903  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.4 
 
 		 239 aa  134  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.71711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4566  DNA-binding transcriptional activator DcuR  37.61 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4698  DNA-binding transcriptional activator DcuR  37.61 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  37.61 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3909  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.12 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  37.61 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420528  normal  0.899721 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0546  response regulator  34.38 
 
 		 235 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000213708  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0490  response regulator  33.04 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00461557  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0615  response regulator  33.92 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4724  response regulator  34.38 
 
 		 235 aa  132  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0039  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.12 
 
 		 240 aa  132  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0488  response regulator  32.59 
 
 		 235 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0045  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.12 
 
 		 240 aa  131  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4415  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  41.15 
 
 		 241 aa  131  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0633  response regulator  32.59 
 
 		 235 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0838  response regulator  33.48 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.873813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0640  response regulator  33.04 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0471  response regulator  42.21 
 
 		 159 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3732  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  36.36 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.655402 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0491  response regulator receiver  33.48 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4345  response regulator  33.48 
 
 		 225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158783  hitchhiker  0.00000000000467704 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2326  response regulator receiver and unknown domain protein  36.61 
 
 		 241 aa  128  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.500594  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1346  response regulator receiver and unknown domain protein  39.25 
 
 		 220 aa  128  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000367941 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0835  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  43.52 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256612  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1119  response regulator  34.8 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704841 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2968  response regulator receiver and unknown domain protein  40.99 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1090  response regulator  32.58 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1005  response regulator  32.58 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.38637e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1010  response regulator  33.03 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4310  response regulator receiver and unknown domain protein  34.36 
 
 		 241 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000453171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0812  response regulator receiver  32.58 
 
 		 225 aa  125  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0577  response regulator  33.33 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0966  response regulator  33.03 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1528  response regulator receiver and unknown domain protein  40 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000318963 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2020  response regulator receiver and unknown domain protein  36 
 
 		 233 aa  123  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0870  response regulator  32.58 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0924  response regulator  32.58 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0528  two-component response regulator, citrate/malate, N-terminus  48.28 
 
 		 127 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1748  response regulator receiver and unknown domain protein  35.59 
 
 		 233 aa  122  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.013924  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2225  response regulator receiver and unknown domain protein  35.53 
 
 		 241 aa  121  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0939  response regulator receiver  34.53 
 
 		 226 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0905  response regulator receiver  34.53 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0354  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  39.45 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3095  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.53 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0654926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3172  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  36.53 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00871756  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>