125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3151 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  100 
 
 
479 aa  969    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  100 
 
 
479 aa  969    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  74.73 
 
 
479 aa  713    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  99.58 
 
 
479 aa  967    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  77.08 
 
 
480 aa  755    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  61.02 
 
 
798 aa  578  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  59.69 
 
 
470 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  51.06 
 
 
480 aa  478  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  50.52 
 
 
480 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  48.65 
 
 
471 aa  415  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  46.31 
 
 
481 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  44.72 
 
 
480 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  48.65 
 
 
479 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  47.1 
 
 
488 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  40.59 
 
 
467 aa  361  1e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  35.67 
 
 
445 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  36.03 
 
 
476 aa  244  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  37.74 
 
 
478 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  35.12 
 
 
488 aa  226  5.0000000000000005e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  35.21 
 
 
445 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  34.82 
 
 
477 aa  224  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  35.91 
 
 
482 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  35.19 
 
 
459 aa  220  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  32.28 
 
 
473 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  34.49 
 
 
482 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  35.11 
 
 
482 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  33.27 
 
 
470 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  35.63 
 
 
476 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  31.9 
 
 
472 aa  206  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  33.55 
 
 
490 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  31.56 
 
 
465 aa  189  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  31.5 
 
 
462 aa  189  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  31.79 
 
 
436 aa  187  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  32.68 
 
 
447 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  30.79 
 
 
436 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  32.08 
 
 
445 aa  177  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  32.05 
 
 
438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  29.58 
 
 
492 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  29.15 
 
 
493 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  31.1 
 
 
442 aa  169  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  29.1 
 
 
461 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  30.62 
 
 
512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  29.94 
 
 
464 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  29.63 
 
 
437 aa  163  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  30.2 
 
 
488 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  30.28 
 
 
488 aa  161  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  28.07 
 
 
490 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  29.55 
 
 
482 aa  159  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  29.87 
 
 
484 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  30.34 
 
 
432 aa  156  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  28.25 
 
 
431 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  29.17 
 
 
462 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  27.65 
 
 
435 aa  154  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  32.4 
 
 
421 aa  153  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  27.86 
 
 
474 aa  150  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  27.15 
 
 
465 aa  149  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  31.36 
 
 
473 aa  143  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  27.7 
 
 
469 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000893  hypothetical protein  27.83 
 
 
435 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  27.75 
 
 
431 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  29.77 
 
 
423 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0254  hypothetical protein  28.08 
 
 
542 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  31.14 
 
 
470 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  29.8 
 
 
479 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  27.13 
 
 
491 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  27.33 
 
 
467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  26.4 
 
 
487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  28.48 
 
 
485 aa  128  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  30.24 
 
 
478 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  30.24 
 
 
478 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  30.33 
 
 
478 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  30.71 
 
 
465 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  30.23 
 
 
472 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  28.61 
 
 
473 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  28.61 
 
 
432 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  28.61 
 
 
473 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  30.98 
 
 
475 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6394  hypothetical protein  24.84 
 
 
491 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  28.46 
 
 
479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  29.7 
 
 
479 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  28.35 
 
 
473 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  28.94 
 
 
478 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  28.35 
 
 
473 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  28.35 
 
 
473 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  28.35 
 
 
473 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  25.88 
 
 
482 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  27.16 
 
 
449 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  43.24 
 
 
200 aa  107  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  26.72 
 
 
484 aa  106  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  38.6 
 
 
222 aa  101  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  24.72 
 
 
452 aa  95.5  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3037  hypothetical protein  25 
 
 
496 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.533722  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  24.66 
 
 
445 aa  92  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  25.26 
 
 
456 aa  89  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4999  hypothetical protein  25.69 
 
 
506 aa  87  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0433305  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  26.24 
 
 
466 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4286  hypothetical protein  25.98 
 
 
480 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4372  hypothetical protein  25.98 
 
 
480 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0578425  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3377  putative lipoprotein  25.55 
 
 
499 aa  77.8  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2624  protein of unknown function DUF1214  26.87 
 
 
459 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000350326  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>