More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3147 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_3209  sugar transporter  100 
 
 
492 aa  968    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.331737 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3159  sugar transporter  100 
 
 
492 aa  968    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10565  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3472  sugar transporter  92.8 
 
 
490 aa  827    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3147  sugar transporter  100 
 
 
492 aa  968    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3055  sugar transporter  84.49 
 
 
494 aa  757    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2527  sugar transporter  68.4 
 
 
491 aa  578  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  67.3 
 
 
482 aa  561  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0802  sugar transporter  62.98 
 
 
496 aa  548  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  57.82 
 
 
474 aa  489  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  57.33 
 
 
487 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  54.45 
 
 
499 aa  467  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  54.19 
 
 
497 aa  457  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  55 
 
 
485 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  55.48 
 
 
493 aa  449  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  55.58 
 
 
544 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  55.58 
 
 
479 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3778  sugar transporter  55.58 
 
 
479 aa  442  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  53.05 
 
 
486 aa  443  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  51.48 
 
 
486 aa  441  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  54.08 
 
 
480 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  50.67 
 
 
468 aa  438  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  50 
 
 
480 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  51.46 
 
 
504 aa  425  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  53.78 
 
 
469 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  48.68 
 
 
466 aa  421  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  50.44 
 
 
474 aa  421  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  50 
 
 
478 aa  421  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  48.19 
 
 
470 aa  414  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0314  sugar transporter  54.79 
 
 
479 aa  408  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1668  sugar transporter  51.05 
 
 
472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2109  sugar transporter  51.27 
 
 
475 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  48.89 
 
 
468 aa  402  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  39.96 
 
 
491 aa  334  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  39.75 
 
 
491 aa  332  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  39.75 
 
 
491 aa  331  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  39.75 
 
 
491 aa  331  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  39.75 
 
 
491 aa  331  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  39.75 
 
 
491 aa  331  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  39.75 
 
 
491 aa  331  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  39.47 
 
 
491 aa  329  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  39.62 
 
 
468 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  37.61 
 
 
448 aa  295  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  37.02 
 
 
485 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  38.02 
 
 
457 aa  283  5.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  32.99 
 
 
477 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  37.42 
 
 
442 aa  276  5e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  36.46 
 
 
450 aa  276  8e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  37.09 
 
 
467 aa  270  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  33.33 
 
 
475 aa  270  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  36.56 
 
 
464 aa  269  7e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  38.19 
 
 
492 aa  266  8e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  36.19 
 
 
480 aa  265  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  36.82 
 
 
438 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  35.9 
 
 
477 aa  259  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  38.03 
 
 
468 aa  258  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  34.42 
 
 
466 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  35.47 
 
 
484 aa  248  2e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  34.13 
 
 
457 aa  245  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  33.26 
 
 
448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  36.03 
 
 
475 aa  243  7.999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  34.77 
 
 
468 aa  242  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  33.62 
 
 
474 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  34.84 
 
 
458 aa  241  2.9999999999999997e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  35.59 
 
 
497 aa  240  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  32.9 
 
 
444 aa  238  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  34.51 
 
 
441 aa  239  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  34.83 
 
 
472 aa  239  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1053  sugar transporter  36.22 
 
 
430 aa  237  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  34.92 
 
 
463 aa  235  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  34.92 
 
 
463 aa  235  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  33.19 
 
 
471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33690  sugar transporter  30.99 
 
 
480 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  32.56 
 
 
459 aa  229  7e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  33.19 
 
 
516 aa  229  7e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  33.11 
 
 
450 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  32.44 
 
 
446 aa  228  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03799  MFS transporter  33.14 
 
 
524 aa  228  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  32.08 
 
 
482 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  35.89 
 
 
447 aa  226  9e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  34.29 
 
 
445 aa  225  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  34.27 
 
 
507 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  31.12 
 
 
477 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  34.42 
 
 
468 aa  220  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  32.54 
 
 
480 aa  219  7e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  32.64 
 
 
480 aa  219  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0654  major facilitator superfamily sugar transporter  35.79 
 
 
443 aa  219  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866655  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  31.03 
 
 
480 aa  218  2e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  32.48 
 
 
476 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  34.78 
 
 
475 aa  215  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  31.49 
 
 
533 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  32.91 
 
 
465 aa  207  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  32.63 
 
 
480 aa  207  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0900  sugar transporter  30.49 
 
 
518 aa  207  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  33.69 
 
 
464 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  34.2 
 
 
464 aa  206  7e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  33.69 
 
 
464 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  33.69 
 
 
464 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  33.69 
 
 
464 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  33.69 
 
 
464 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  34.2 
 
 
464 aa  205  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>