More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3104 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3396  acyl-CoA synthetase  54.97 
 
 		 592 aa  639    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.733588  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11562  acyl-CoA synthetase  61.13 
 
 		 584 aa  696    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12944  acyl-CoA synthetase  56.38 
 
 		 626 aa  649    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13860  acyl-CoA synthetase  58.72 
 
 		 584 aa  674    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11209  acyl-CoA synthetase  58.48 
 
 		 578 aa  692    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3129  acyl-CoA synthetase  54.62 
 
 		 592 aa  641    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.853236  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11554  acyl-CoA synthetase  61.68 
 
 		 583 aa  724    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3104  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 601 aa  1223    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3124  acyl-CoA synthetase  99.83 
 
 		 601 aa  1221    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12955  acyl-CoA synthetase  60 
 
 		 580 aa  696    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3164  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 601 aa  1223    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254716  normal  0.383191 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2880  acyl-CoA synthetase  57.59 
 
 		 631 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.894395  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2867  acyl-CoA synthetase  57.76 
 
 		 580 aa  633  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.70026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12964  acyl-CoA synthetase  54.53 
 
 		 619 aa  630  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2836  acyl-CoA synthetase  57.59 
 
 		 580 aa  631  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.562117  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0402  acyl-CoA synthetase  54.45 
 
 		 573 aa  620  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795318  normal  0.658379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3127  acyl-CoA synthetase  52.59 
 
 		 576 aa  618  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274694  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0272  acyl-CoA synthetase  53.98 
 
 		 573 aa  615  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984727  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0237  acyl-CoA synthetase  53.12 
 
 		 590 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0247  acyl-CoA synthetase  52.78 
 
 		 590 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0257  acyl-CoA synthetase  52.78 
 
 		 590 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3394  acyl-CoA synthetase  51.21 
 
 		 577 aa  594  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.682932  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10409  acyl-CoA synthetase  44.02 
 
 		 585 aa  486  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4760  AMP-dependent synthetase and ligase  39.15 
 
 		 597 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8830  peptide synthetase  39.61 
 
 		 574 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426227  decreased coverage  0.000549729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  37.35 
 
 		 1656 aa  360  5e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  34.43 
 
 		 611 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.56 
 
 		 629 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3604  putative fatty-acid--CoA ligase  38.27 
 
 		 593 aa  348  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.698537  normal  0.297666 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13835  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.23 
 
 		 637 aa  346  8.999999999999999e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331415  normal  0.284181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.39 
 
 		 629 aa  345  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  36.61 
 
 		 1067 aa  345  2e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5011  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.39 
 
 		 629 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5099  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.39 
 
 		 629 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  37.44 
 
 		 582 aa  344  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11954  putative fatty-acid--CoA ligase  37.75 
 
 		 620 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.607108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5392  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.39 
 
 		 629 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.117566 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0174  AMP-dependent synthetase and ligase  36.02 
 
 		 636 aa  340  2.9999999999999998e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121627  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 		 640 aa  338  9.999999999999999e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.541656  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  36.58 
 
 		 725 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  36.58 
 
 		 725 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  35.53 
 
 		 579 aa  337  3.9999999999999995e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 		 578 aa  337  5e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  38.41 
 
 		 599 aa  334  3e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3869  putative fatty-acid--CoA ligase  36.73 
 
 		 605 aa  332  9e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3943  putative fatty-acid--CoA ligase  36.73 
 
 		 605 aa  332  9e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.082676  normal  0.0172927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  37.24 
 
 		 4332 aa  332  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  33.22 
 
 		 2997 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3855  putative fatty-acid--CoA ligase  36.73 
 
 		 605 aa  331  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724696  hitchhiker  0.00746256 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  37.76 
 
 		 6403 aa  329  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2901  putative fatty-acid--CoA ligase  36.47 
 
 		 593 aa  327  6e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.650918  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2966  putative fatty-acid--CoA ligase  36.71 
 
 		 607 aa  326  9e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.453521  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  33.8 
 
 		 581 aa  326  1e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  33.8 
 
 		 581 aa  324  2e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  36.97 
 
 		 3235 aa  324  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  37.09 
 
 		 4318 aa  323  4e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  36.22 
 
 		 4317 aa  323  6e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  36.05 
 
 		 4317 aa  323  7e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  33.45 
 
 		 597 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  34.02 
 
 		 2762 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  36.63 
 
 		 2791 aa  320  3e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  36.63 
 
 		 2721 aa  321  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  36.72 
 
 		 592 aa  320  5e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  33.45 
 
 		 597 aa  320  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  36.05 
 
 		 4317 aa  320  7e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  36.79 
 
 		 1801 aa  319  7e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  35.26 
 
 		 586 aa  319  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 595 aa  318  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  36.4 
 
 		 4336 aa  318  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  37.12 
 
 		 610 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 		 596 aa  315  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  35 
 
 		 608 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 		 991 aa  313  5.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 		 614 aa  312  1e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  35.56 
 
 		 609 aa  312  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  34.48 
 
 		 588 aa  311  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  36.76 
 
 		 610 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1754  acyl-CoA synthetase  31.95 
 
 		 564 aa  311  2.9999999999999997e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  36.76 
 
 		 599 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  36.76 
 
 		 599 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  36.76 
 
 		 599 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0433  AMP-binding enzyme family protein  31.95 
 
 		 559 aa  310  4e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  36.76 
 
 		 610 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  35.9 
 
 		 2103 aa  309  8e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1161  saframycin Mx1 synthetase B  34.69 
 
 		 617 aa  309  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2789  AMP-binding domain-containing protein  34.69 
 
 		 617 aa  309  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472303  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  34.94 
 
 		 3231 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  35.86 
 
 		 4336 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2943  Acyl-CoA synthetases  33.9 
 
 		 617 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  35.48 
 
 		 4317 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  34.82 
 
 		 755 aa  305  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 		 602 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  35.63 
 
 		 2820 aa  305  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0276  AMP-binding domain-containing protein  33.28 
 
 		 620 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  33.62 
 
 		 1474 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2099  AMP-binding domain-containing protein  34.19 
 
 		 622 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335161  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0523  AMP-binding enzyme  34.41 
 
 		 621 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.746199  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  36.61 
 
 		 4342 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1459  AMP-binding domain-containing protein  34.24 
 
 		 621 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1849  AMP-binding domain-containing protein  34.24 
 
 		 621 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>