More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3074 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  71.96 
 
 		 190 aa  240  7.999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  68.25 
 
 		 190 aa  224  6e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  48.47 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3070  transcriptional regulator, TetR family  45.06 
 
 		 216 aa  125  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  40.76 
 
 		 199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  40.31 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  37.86 
 
 		 213 aa  91.3  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 218 aa  85.1  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 200 aa  84.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  36.18 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  36.18 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  36.18 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  37.75 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  37.91 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  34.63 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  31 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  32.19 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1495  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.969103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  29.85 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19490  transcriptional regulator, tetR family  53.45 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  31.6 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 239 aa  61.2  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 173 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  30.11 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 258 aa  58.2  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  26.95 
 
 		 210 aa  57  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  25.69 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  38.37 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 259 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  45.83 
 
 		 343 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 234 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0632  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.639401  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3985  hypothetical protein  36.9 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  31.2 
 
 		 245 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 237 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 246 aa  52.8  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04290  transcriptional regulator  23.04 
 
 		 230 aa  52.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0356089  normal  0.115644 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  32.17 
 
 		 227 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  39.08 
 
 		 262 aa  52.4  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 219 aa  52  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 238 aa  52  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 248 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 221 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  37.86 
 
 		 226 aa  51.2  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 234 aa  51.2  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  31.47 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>