More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2905 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 263 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 263 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  99.24 
 
 		 263 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  76.98 
 
 		 265 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  76.98 
 
 		 265 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2838  two component transcriptional regulator  79.28 
 
 		 251 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.692986  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  79.44 
 
 		 248 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  80.08 
 
 		 251 aa  381  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  81.78 
 
 		 251 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  76.4 
 
 		 251 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  75.2 
 
 		 251 aa  360  1e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  73.14 
 
 		 246 aa  354  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  73.14 
 
 		 246 aa  343  1e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  73.14 
 
 		 246 aa  343  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  62.34 
 
 		 233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.39 
 
 		 237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  63.04 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  58.3 
 
 		 244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  58.3 
 
 		 244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.61 
 
 		 243 aa  264  8.999999999999999e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  62.88 
 
 		 230 aa  263  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.77 
 
 		 232 aa  255  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  58.26 
 
 		 240 aa  252  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  56.9 
 
 		 239 aa  242  3.9999999999999997e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  54.15 
 
 		 231 aa  240  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04920  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  56.52 
 
 		 222 aa  236  3e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.81 
 
 		 231 aa  227  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2050  response regulator receiver  51.9 
 
 		 250 aa  215  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.79 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  46.93 
 
 		 227 aa  201  7e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.44 
 
 		 232 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.44 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0867  two component transcriptional regulator  46.86 
 
 		 250 aa  198  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0978  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.75 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0385223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2207  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.09 
 
 		 244 aa  195  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  48.03 
 
 		 228 aa  195  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  44.3 
 
 		 226 aa  191  9e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.98 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  45.53 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2939  response regulator receiver  50.65 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  47.35 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2924  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.95 
 
 		 265 aa  189  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  48.9 
 
 		 229 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  47.79 
 
 		 229 aa  189  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.39 
 
 		 237 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 		 235 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.65 
 
 		 226 aa  188  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.72 
 
 		 226 aa  188  7e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.17 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 244 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  45.22 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  45.22 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  45.22 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  45.22 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  45.22 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  45.22 
 
 		 235 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  45.22 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 228 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  45.22 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  43.35 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  44.3 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  44.78 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  45.92 
 
 		 229 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 228 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 228 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 228 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 228 aa  185  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0854  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.92 
 
 		 248 aa  186  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0313558 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 		 229 aa  184  9e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  45.61 
 
 		 230 aa  184  9e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 231 aa  184  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  42.55 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  43.72 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  43.42 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  44.74 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.86 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  46.05 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  45.41 
 
 		 229 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 226 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.16 
 
 		 234 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.74 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.4 
 
 		 237 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 237 aa  182  6e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.49 
 
 		 237 aa  182  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1773  two component transcriptional regulator  44.31 
 
 		 260 aa  181  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178114  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.85 
 
 		 225 aa  181  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.09 
 
 		 223 aa  181  9.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7054  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.83 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  46.55 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 226 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.67 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 230 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>