More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2862 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_2906  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
384 aa  716    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894257  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2892  sodium/hydrogen exchanger  99.74 
 
 
384 aa  712    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2862  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
384 aa  716    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13265  integral membrane transport protein  75.99 
 
 
385 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.53552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2651  sodium/hydrogen exchanger  67.29 
 
 
373 aa  401  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172671  decreased coverage  0.000202867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0408  sodium/hydrogen exchanger  58.51 
 
 
388 aa  320  3e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1612  sodium/hydrogen exchanger  50 
 
 
393 aa  315  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.716831  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0084  sodium/hydrogen exchanger  51.34 
 
 
436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2800  sodium/hydrogen exchanger  61.38 
 
 
387 aa  302  6.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1752  sodium/hydrogen exchanger  50.54 
 
 
409 aa  300  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3663  sodium/hydrogen exchanger  49.35 
 
 
393 aa  283  5.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0918  sodium/hydrogen exchanger  49.74 
 
 
394 aa  282  7.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272174  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1893  sodium/hydrogen exchanger  52.15 
 
 
395 aa  279  5e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285532  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3880  sodium/hydrogen exchanger family protein  50 
 
 
386 aa  278  9e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4657  sodium/hydrogen exchanger  53.06 
 
 
436 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2225  sodium/hydrogen exchanger  52.12 
 
 
404 aa  267  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3876  sodium/hydrogen exchanger  48.34 
 
 
396 aa  266  5e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0119  sodium/hydrogen exchanger  51.34 
 
 
401 aa  258  9e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0118  sodium/hydrogen exchanger  51.03 
 
 
401 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1158  sodium/hydrogen exchanger  46.72 
 
 
388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.637442  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2649  sodium/hydrogen exchanger  52.03 
 
 
399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19020  Kef-type K+ transport system, membrane component  48.63 
 
 
415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0798  sodium/hydrogen exchanger  36.6 
 
 
403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.539065  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4877  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.3 
 
 
407 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0384  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.3 
 
 
407 aa  166  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4853  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.56 
 
 
407 aa  166  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4863  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.3 
 
 
407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4884  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.04 
 
 
407 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4492  Na+/H+ antiporter  32.04 
 
 
407 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4572  sodium/hydrogen exchanger  32.04 
 
 
407 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4474  Na+/H+ antiporter  32.3 
 
 
407 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4639  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.04 
 
 
393 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4993  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.04 
 
 
393 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.850719  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4871  sodium/hydrogen exchanger  31.93 
 
 
399 aa  153  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.813703  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4775  Na+/H+ antiporter  31.93 
 
 
399 aa  153  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.169433  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4911  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.66 
 
 
399 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5286  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.66 
 
 
399 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5187  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.66 
 
 
399 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3108  sodium/hydrogen exchanger  29.4 
 
 
400 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.315718  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5193  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.66 
 
 
399 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.147358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1889  hypothetical protein  37.77 
 
 
403 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993371  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5201  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.66 
 
 
399 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0056  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.66 
 
 
399 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0399092  hitchhiker  0.000000129264 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4756  Na+/H+ antiporter  31.66 
 
 
399 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.586497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5156  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.66 
 
 
399 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3609399999999994e-21 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3239  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
405 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2190  sodium/hydrogen exchanger  32.83 
 
 
427 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4477  sodium/hydrogen exchanger  34.65 
 
 
400 aa  142  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92242  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2065  Sodium/hydrogen exchanger  32.72 
 
 
408 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0630296 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0232  sodium/hydrogen exchanger  29.74 
 
 
412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.568377  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0363  sodium/hydrogen exchanger  34.34 
 
 
414 aa  130  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624328 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1518  sodium/hydrogen exchanger  32.26 
 
 
411 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1207  sodium/hydrogen exchanger  31.76 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000156939  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0861  sodium/hydrogen exchanger  28.78 
 
 
395 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1555  sodium/hydrogen exchanger  29.76 
 
 
391 aa  107  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000544506  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  30.58 
 
 
747 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  28.89 
 
 
586 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  29.21 
 
 
586 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  29.24 
 
 
586 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  28.79 
 
 
567 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  28.98 
 
 
586 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  27.2 
 
 
741 aa  101  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  29.2 
 
 
567 aa  99.8  8e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  28.46 
 
 
587 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.94 
 
 
567 aa  96.7  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.77 
 
 
587 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  28.76 
 
 
741 aa  96.3  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.46 
 
 
587 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  29.91 
 
 
782 aa  94.7  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  28.81 
 
 
666 aa  94  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  29.63 
 
 
659 aa  92.8  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  34.85 
 
 
670 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  28.16 
 
 
662 aa  92  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  28.03 
 
 
586 aa  92.8  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  28.24 
 
 
585 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  27.11 
 
 
745 aa  90.9  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  28.22 
 
 
585 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  27.11 
 
 
757 aa  90.5  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  28.1 
 
 
654 aa  90.5  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26.67 
 
 
671 aa  90.1  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  29.75 
 
 
658 aa  89.7  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  29.14 
 
 
674 aa  90.1  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  31.12 
 
 
775 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  29.56 
 
 
710 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  26.67 
 
 
652 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  29.27 
 
 
441 aa  89.4  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  28.92 
 
 
664 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  29.92 
 
 
585 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  30.08 
 
 
673 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  30.06 
 
 
575 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0711  sodium/hydrogen exchanger  29.26 
 
 
581 aa  87  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  29.87 
 
 
585 aa  86.7  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  28.68 
 
 
585 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 
741 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4597  sodium/hydrogen exchanger  30.49 
 
 
777 aa  85.5  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  30.05 
 
 
662 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0891  sodium/hydrogen exchanger  28.3 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.155242  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  27.89 
 
 
652 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  30.29 
 
 
556 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  29.23 
 
 
648 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>