53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2825 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  100 
 
 
542 aa  1094    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  100 
 
 
542 aa  1094    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  100 
 
 
542 aa  1094    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  40.48 
 
 
494 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  44.24 
 
 
458 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  36.13 
 
 
528 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  28.41 
 
 
540 aa  98.2  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0949  PE-PPE-like protein  29.58 
 
 
529 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0967  hypothetical protein  29.58 
 
 
529 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0508627 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  28.49 
 
 
517 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  28.49 
 
 
517 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  31.27 
 
 
527 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  31.67 
 
 
499 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  29.32 
 
 
526 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  36.14 
 
 
307 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  36.14 
 
 
307 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  28.02 
 
 
517 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  36.14 
 
 
307 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  26.8 
 
 
502 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  33.64 
 
 
427 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  29.97 
 
 
580 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  31.58 
 
 
401 aa  77  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  30.3 
 
 
391 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  31.92 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  31.92 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1918  hypothetical protein  28.47 
 
 
533 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.777477  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  33.85 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5244  hypothetical protein  31.15 
 
 
433 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  30.28 
 
 
783 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  32.2 
 
 
401 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  28.52 
 
 
588 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  30.43 
 
 
517 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  26.69 
 
 
433 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  26.69 
 
 
433 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  27.99 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  27.33 
 
 
533 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  30.43 
 
 
468 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3102  hypothetical protein  31.19 
 
 
410 aa  62  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057545  normal  0.238846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
469 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  27.35 
 
 
655 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1238  hypothetical protein  25.89 
 
 
518 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  31.34 
 
 
768 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  29.8 
 
 
421 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2068  hypothetical protein  33.99 
 
 
432 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183001  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  29.18 
 
 
404 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4081  hypothetical protein  26.4 
 
 
461 aa  52  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0716576  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  26.44 
 
 
479 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1838  hypothetical protein  25.1 
 
 
435 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1597  hypothetical protein  26.8 
 
 
898 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.489596 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4398  hypothetical protein  25.8 
 
 
437 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4312  hypothetical protein  25.8 
 
 
437 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.400597  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4692  hypothetical protein  25.8 
 
 
437 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3371  hypothetical protein  31.75 
 
 
431 aa  45.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21394  normal  0.757107 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>