More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2727 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2727  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.45563  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2771  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2757  GntR family transcriptional regulator  97.49 
 
 		 239 aa  427  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.578268  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2942  regulatory protein GntR, HTH  81.86 
 
 		 240 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0684718  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10597  GntR family transcriptional regulator  66.09 
 
 		 240 aa  288  4e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0011  GntR family transcriptional regulator  65.55 
 
 		 249 aa  265  5e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4488  regulatory protein GntR HTH  57.98 
 
 		 252 aa  243  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7456  regulatory protein GntR HTH  43.86 
 
 		 237 aa  128  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0768739  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 233 aa  89  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6769  regulatory protein GntR HTH  31.82 
 
 		 261 aa  88.6  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  36.42 
 
 		 240 aa  85.1  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  28.22 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  35.76 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0114  regulatory protein GntR HTH  27.4 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1196  regulatory protein GntR HTH  35.65 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.185208  hitchhiker  0.000709934 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0277  regulatory protein GntR HTH  39.67 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  31.65 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  29.17 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  34.72 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1972  putative pyruvate dehydrogenase complex repressor  33.14 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510687  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  35.51 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3778  transcriptional regulator PdhR  28.21 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10503  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000487705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  26.67 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0318  transcriptional regulator PdhR  28.15 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  29.57 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  29.57 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  29.57 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  29.57 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  27.43 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  33.82 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  41.6 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  29.13 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.13 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  29.13 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  29.13 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  29.13 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  35.17 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0418  transcriptional regulator PdhR  28.33 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0357  regulatory protein GntR HTH  30.67 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000241267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  31.11 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3776  regulatory protein GntR HTH  33.62 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0209412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0430  transcriptional regulator PdhR  26.92 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096101 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2087  fatty acid responsive transcription factor FadR domain protein  36.59 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30946e-19 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  37.86 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2130  regulatory protein GntR HTH  35.77 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0857174  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  32.91 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1490  fatty acid metabolism regulator  32.54 
 
 		 279 aa  72  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  43.84 
 
 		 235 aa  72  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  29.31 
 
 		 250 aa  72  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  28.51 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  35.04 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  44.44 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  27.03 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.83 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0673  transcriptional regulator PdhR  30.04 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  44.44 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  30.49 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  42.06 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5249  regulatory protein GntR HTH  30.92 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002979  transcriptional regulator for fatty acid degradation FadR GntR family  29.51 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  30.92 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2520  GntR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  29.41 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.92 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5035  regulatory protein GntR, HTH  30.92 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02929  fatty acid metabolism regulator  29.51 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  46.05 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3569  transcriptional regulator PdhR  29.63 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  31.58 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3755  transcriptional regulator PdhR  30.33 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.31 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  45.37 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.63 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2617  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1661  fatty acid metabolism regulator  25.6 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0855025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  30 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3584  GntR-like  27.94 
 
 		 275 aa  68.6  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01148  fatty acid metabolism regulator  42.47 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0433911  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3603  GntR domain-containing protein  28.69 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550725  normal  0.904969 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2794  fatty acid metabolism regulator  42.47 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00556903  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2147  fatty acid metabolism regulator  24.5 
 
 		 280 aa  68.6  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102966  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.39 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  29.22 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  30.61 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.39 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>