49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2528 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_2573  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  547  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2528  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  547  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2565  hypothetical protein  99.26 
 
 
270 aa  543  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  60.92 
 
 
277 aa  308  5e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3381  hypothetical protein  61.15 
 
 
277 aa  280  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981004  normal  0.259462 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4413  hypothetical protein  51.31 
 
 
285 aa  240  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0436871  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3942  hypothetical protein  40.68 
 
 
260 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4522  hypothetical protein  39.93 
 
 
284 aa  151  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0053  hypothetical protein  36.88 
 
 
276 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0984909  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0062  hypothetical protein  36.88 
 
 
276 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.847776  normal  0.0297452 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0043  hypothetical protein  36.88 
 
 
276 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257103  normal  0.0357536 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  36.12 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0060  hypothetical protein  34.24 
 
 
268 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0790  hypothetical protein  34.12 
 
 
268 aa  122  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  27.8 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  27.94 
 
 
257 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  29.19 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  27.59 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  28.64 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  30.74 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  27.13 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  26.3 
 
 
269 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  26.74 
 
 
262 aa  67  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  28.91 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  25.35 
 
 
268 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  27.87 
 
 
263 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1417  hypothetical protein  27.38 
 
 
254 aa  59.3  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1720  hypothetical protein  24.39 
 
 
271 aa  57  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  23.53 
 
 
267 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  23.83 
 
 
276 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  23.53 
 
 
267 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2000  hypothetical protein  23.57 
 
 
271 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.422215  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  23.92 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  31.18 
 
 
270 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  31.18 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  31.18 
 
 
270 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  24.22 
 
 
270 aa  52.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15480  hypothetical protein  25.1 
 
 
276 aa  52.4  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00643859  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2221  hypothetical protein  29.22 
 
 
256 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986001  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  25 
 
 
267 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3647  hypothetical protein  27.16 
 
 
265 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.51576  hitchhiker  0.00000000000126361 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  25.1 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  24.14 
 
 
276 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2151  hypothetical protein  28.35 
 
 
276 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1506  hypothetical protein  24.41 
 
 
263 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.168782 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10540  hypothetical protein  25.53 
 
 
288 aa  45.8  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11001  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  26.3 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0454  hypothetical protein  25.82 
 
 
258 aa  43.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1778  hypothetical protein  24.7 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00279828  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>