135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2485 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2485  cobalt-precorrin-6x reductase  100 
 
 
242 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2530  cobalt-precorrin-6x reductase  100 
 
 
242 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2522  cobalt-precorrin-6x reductase  97.11 
 
 
242 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12106  cobalt-precorrin-6x reductase  67.36 
 
 
244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165074  normal  0.705272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2478  precorrin-6x reductase  56.38 
 
 
244 aa  229  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0390699  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2180  precorrin-6x reductase  53.06 
 
 
248 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0136003  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2739  cobalt-precorrin-6x reductase  44.72 
 
 
252 aa  188  5e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0747566  normal  0.206921 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1548  precorrin-6x reductase  41.32 
 
 
249 aa  188  5.999999999999999e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1780  precorrin-6x reductase  54.36 
 
 
241 aa  186  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171878  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0021  cobalt-precorrin-6x reductase  46.69 
 
 
246 aa  186  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.342454 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2500  precorrin-6x reductase  52.28 
 
 
244 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0359  precorrin-6x reductase  53.28 
 
 
244 aa  176  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17710  precorrin-6A reductase  51.29 
 
 
250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262033  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5596  Precorrin-6A reductase  52.24 
 
 
250 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340084  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0566  precorrin-6x reductase  50.83 
 
 
253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4722  precorrin-6x reductase  45.42 
 
 
273 aa  171  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  0.411006 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0256  cobalt-precorrin-6x reductase  45.87 
 
 
245 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000182781  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5189  precorrin-6x reductase  45.81 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2154  precorrin-6x reductase  45.9 
 
 
253 aa  164  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0179311  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1614  precorrin-6x reductase  53.09 
 
 
239 aa  164  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2881  precorrin-6A reductase  50 
 
 
243 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0378  precorrin-6x reductase  52.65 
 
 
245 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.656441  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  49.18 
 
 
268 aa  159  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0287326  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6989  precorrin-6x reductase  44.35 
 
 
250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463236  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2317  cobalt-precorrin-6x reductase  43.1 
 
 
249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.398392  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1927  precorrin-6x reductase  46.59 
 
 
253 aa  155  8e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.338007  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5478  cobalt-precorrin-6x reductase  47.33 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0805  precorrin-6x reductase  43.03 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.955549  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2377  cobalt-precorrin-6x reductase  39.33 
 
 
249 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1299  cobalt-precorrin-6x reductase  41.39 
 
 
248 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0176  precorrin-6x reductase  49.79 
 
 
248 aa  149  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1263  cobalt-precorrin-6x reductase  41.39 
 
 
248 aa  150  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3512  precorrin-6x reductase  44.14 
 
 
255 aa  150  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.42135  normal  0.748332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2988  precorrin-6A reductase  47.37 
 
 
251 aa  148  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2825  cobalt-precorrin-6x reductase  42.02 
 
 
247 aa  148  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3181  cobalt-precorrin-6x reductase  40.5 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264616  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1472  cobalt-precorrin-6x reductase  42.02 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5847  precorrin-6x reductase  42.54 
 
 
249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.760322  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2443  precorrin-6x reductase  44.9 
 
 
253 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00747936  normal  0.0784333 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1886  cobalt-precorrin-6x reductase  41.89 
 
 
248 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3149  precorrin-6A reductase  40.57 
 
 
257 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5261  precorrin-6x reductase  45.61 
 
 
271 aa  142  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.527912  normal  0.416364 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  41.74 
 
 
247 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.642834  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3120  precorrin-6A reductase  42.29 
 
 
265 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2926  precorrin-6A reductase  38.11 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.422905  hitchhiker  0.00352486 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2628  cobalt-precorrin-6x reductase  43.24 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0310  precorrin-6A reductase  44.21 
 
 
248 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2814  cobalt-precorrin-6x reductase  42.86 
 
 
266 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1885  cobalt-precorrin-6x reductase  39.02 
 
 
259 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2215  precorrin-6A reductase  37.75 
 
 
253 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4710  cobalt-precorrin-6x reductase  39.91 
 
 
239 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.54445 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1690  precorrin-6A reductase  41.84 
 
 
248 aa  135  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0972101  normal  0.0269101 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0337  cobalt-precorrin-6x reductase  42.11 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3281  precorrin-6x reductase  42.86 
 
 
287 aa  131  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4832  cobalt-precorrin-6x reductase  40.44 
 
 
239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0805988  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4622  cobalt-precorrin-6x reductase  40.18 
 
 
239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44815  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4569  cobalt-precorrin-6x reductase  40.71 
 
 
239 aa  125  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7178  cobalt-precorrin-6x reductase  41.39 
 
 
256 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183428  normal  0.0616428 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4420  cobalt-precorrin-6x reductase  36.82 
 
 
246 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4880  precorrin-6x reductase, putative  36.55 
 
 
246 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0601  cobalt-precorrin-6x reductase  37.87 
 
 
242 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156008  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2537  precorrin-6A reductase  36.91 
 
 
230 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.571905  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5688  precorrin-6x reductase  41.91 
 
 
250 aa  122  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0122424  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4888  cobalt-precorrin-6x reductase  40.09 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179164  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6023  cobalt-precorrin-6x reductase  41.22 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00000257009  normal  0.17843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5366  cobalt-precorrin-6x reductase  37.45 
 
 
242 aa  118  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.791925 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26460  cobalt-precorrin-6x reductase  37.66 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00807093  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1158  cobalt-precorrin-6x reductase  43.59 
 
 
244 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.358764  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1599  cobalt-precorrin-6x reductase  43.59 
 
 
244 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00760442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0260  cobalt-precorrin-6x reductase  43.59 
 
 
244 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0900  cobalt-precorrin-6x reductase  43.59 
 
 
244 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2116  cobalt-precorrin-6x reductase  44.02 
 
 
244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253146  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1197  cobalt-precorrin-6x reductase  38.89 
 
 
243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1677  cobalt-precorrin-6x reductase  38.89 
 
 
243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206927  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1954  cobalt-precorrin-6x reductase  44.02 
 
 
244 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1971  cobalt-precorrin-6x reductase  44.02 
 
 
244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3140  cobalt-precorrin-6x reductase  37.5 
 
 
245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167362  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3263  precorrin-6x reductase  41.99 
 
 
253 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101094 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3377  precorrin-6A reductase  36.02 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.223591 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2245  cobalt-precorrin-6x reductase  36.36 
 
 
242 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2395  cobalt-precorrin-6x reductase  41.03 
 
 
256 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1650  cobalt-precorrin-6x reductase  39.32 
 
 
243 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1248  cobalt-precorrin-6x reductase  36.6 
 
 
242 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0495203  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1301  precorrin-6x reductase  29.49 
 
 
261 aa  89  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  28.86 
 
 
407 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4828  cobalt-precorrin-6x reductase  39.15 
 
 
243 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0932291 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0316  precorrin-6x reductase  30.77 
 
 
249 aa  86.3  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1565  cobalt-precorrin-6x reductase  39.15 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108176  normal  0.15041 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1577  cobalt-precorrin-6x reductase  38.5 
 
 
246 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167988  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0937  precorrin-6x reductase  34.44 
 
 
255 aa  79  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0618  bifunctional: precorrin-3 methyltransferase/precorrin-6X reductase oxidoreductase protein  33.69 
 
 
519 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157389  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1595  cobalt-precorrin-6x reductase  37.18 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635785  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1095  precorrin-6A reductase  32.65 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2614  precorrin-6x reductase  31.15 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2355  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.26 
 
 
512 aa  73.2  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0146728  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1297  precorrin-6x reductase  30.24 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514043 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4032  cobalt-precorrin-6x reductase  25.83 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0936  precorrin-6x reductase  27.71 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0236244 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3647  precorrin-6x reductase  29.25 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.496702 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4070  cobalt-precorrin-6x reductase  25.42 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>