114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2471 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0426  hypothetical protein  97.18 
 
 
434 aa  828    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1187  hypothetical protein  96.44 
 
 
430 aa  813    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102985  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2471  hypothetical protein  100 
 
 
445 aa  900    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0436  hypothetical protein  97.39 
 
 
430 aa  821    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257628  normal  0.0261589 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1204  hypothetical protein  96.44 
 
 
430 aa  813    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2516  hypothetical protein  100 
 
 
445 aa  900    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0413  hypothetical protein  95.96 
 
 
426 aa  806    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1214  hypothetical protein  96.44 
 
 
426 aa  807    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2479  hypothetical protein  95.96 
 
 
430 aa  811    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2508  hypothetical protein  97.02 
 
 
441 aa  845    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.0045565  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0040  hypothetical protein  68.51 
 
 
436 aa  591  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1846  hypothetical protein  73.99 
 
 
434 aa  594  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785639  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3744  hypothetical protein  73.57 
 
 
436 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11790  hypothetical protein  68.68 
 
 
418 aa  592  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.8127e-48  hitchhiker  0.00000599328 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3732  hypothetical protein  71.89 
 
 
438 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3805  hypothetical protein  71.89 
 
 
438 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.0784296 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5006  hypothetical protein  72.9 
 
 
435 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0237713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5094  hypothetical protein  72.9 
 
 
435 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4558  hypothetical protein  63.09 
 
 
489 aa  565  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2442  hypothetical protein  73.01 
 
 
440 aa  568  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5387  hypothetical protein  71.16 
 
 
437 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0273  hypothetical protein  66.08 
 
 
466 aa  556  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.88175  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2373  hypothetical protein  63.54 
 
 
480 aa  536  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.022356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4621  hypothetical protein  62.23 
 
 
481 aa  537  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.957856  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1988  hypothetical protein  68.07 
 
 
436 aa  536  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2401  hypothetical protein  75.3 
 
 
256 aa  348  8e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1866  hypothetical protein  64.93 
 
 
320 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.974528  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1865  HNH endonuclease  83.8 
 
 
142 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  30 
 
 
441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2402  hypothetical protein  68.49 
 
 
116 aa  103  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  26.4 
 
 
458 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4861  HNH endonuclease  29.67 
 
 
472 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  46.94 
 
 
485 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  47.42 
 
 
469 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  39.81 
 
 
494 aa  76.6  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  25.47 
 
 
413 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1280  HNH nuclease  41.35 
 
 
414 aa  73.6  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  39.68 
 
 
661 aa  73.2  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  37.36 
 
 
255 aa  73.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  34.11 
 
 
408 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  38.89 
 
 
469 aa  71.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3452  HNH endonuclease  29.77 
 
 
341 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  24.26 
 
 
407 aa  70.1  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  41.35 
 
 
464 aa  70.1  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  39.37 
 
 
442 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  35.04 
 
 
432 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  32.82 
 
 
561 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  34.27 
 
 
414 aa  63.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  34.81 
 
 
418 aa  63.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  35.94 
 
 
627 aa  63.2  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  36.73 
 
 
546 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  36.43 
 
 
414 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  36.21 
 
 
620 aa  61.6  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  35.71 
 
 
418 aa  61.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  32.79 
 
 
417 aa  60.5  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  33.85 
 
 
572 aa  60.1  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2722  HNH nuclease  41.56 
 
 
571 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265119  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  36 
 
 
620 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01520  HNH endonuclease  38.1 
 
 
504 aa  57.4  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  36.05 
 
 
540 aa  57.4  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  34.34 
 
 
508 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  33.65 
 
 
222 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  35.14 
 
 
585 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  35.71 
 
 
566 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  33.93 
 
 
532 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  38.36 
 
 
507 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  34.23 
 
 
556 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  35.14 
 
 
568 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4442  HNH endonuclease  42.11 
 
 
567 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  34.52 
 
 
531 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  45.07 
 
 
290 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  34.52 
 
 
437 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0461  HNH endonuclease  33.07 
 
 
575 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  32.26 
 
 
499 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2806  HNH endonuclease  43.94 
 
 
582 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  32.52 
 
 
580 aa  50.8  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  37 
 
 
628 aa  51.2  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  35.43 
 
 
526 aa  50.8  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  32.43 
 
 
391 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1416  HNH endonuclease  43.94 
 
 
582 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1011  hypothetical protein  45.76 
 
 
564 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0994  HNH nuclease  37.93 
 
 
153 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.497036  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2991  HNH nuclease  40.24 
 
 
584 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.76476  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  29.31 
 
 
580 aa  49.7  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0743  hypothetical protein  45.76 
 
 
553 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49119  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  38.67 
 
 
497 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  38.67 
 
 
518 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  30.84 
 
 
535 aa  48.9  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  36.36 
 
 
535 aa  48.5  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0977  HNH endonuclease  46.81 
 
 
200 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.592566  hitchhiker  0.000615877 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4452  HNH endonuclease  41.18 
 
 
555 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.673536  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  31.43 
 
 
605 aa  47.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  34.52 
 
 
584 aa  47.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0792  hypothetical protein  38.75 
 
 
553 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1070  hypothetical protein  38.75 
 
 
554 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.495852  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0795  hypothetical protein  44.44 
 
 
552 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125968  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1075  hypothetical protein  45.76 
 
 
558 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.128214  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  37.33 
 
 
495 aa  47  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  37.33 
 
 
513 aa  47  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2447  HNH endonuclease  34.34 
 
 
592 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>