More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2389 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  99.51 
 
 		 203 aa  397  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 203 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 203 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  77.11 
 
 		 201 aa  311  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  80.3 
 
 		 205 aa  306  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  78.28 
 
 		 203 aa  301  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  72.95 
 
 		 207 aa  288  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  70.56 
 
 		 215 aa  271  6e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  69.12 
 
 		 209 aa  260  8.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  68.18 
 
 		 202 aa  249  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  66.01 
 
 		 220 aa  242  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  65.83 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  66.5 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  62.38 
 
 		 223 aa  235  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  69.54 
 
 		 212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  65.35 
 
 		 205 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  59.62 
 
 		 204 aa  229  3e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  60.49 
 
 		 210 aa  227  7e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  62.31 
 
 		 202 aa  226  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  62.44 
 
 		 208 aa  226  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  60.78 
 
 		 217 aa  217  8.999999999999998e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  61.95 
 
 		 204 aa  216  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  54.75 
 
 		 227 aa  208  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  58.42 
 
 		 200 aa  207  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  54.55 
 
 		 193 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  55.72 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  56.78 
 
 		 208 aa  197  7.999999999999999e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  52.21 
 
 		 238 aa  195  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  53.73 
 
 		 222 aa  189  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  53.62 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  52.71 
 
 		 215 aa  184  8e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  51.76 
 
 		 221 aa  181  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  52.71 
 
 		 204 aa  181  9.000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  47.24 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  51.98 
 
 		 196 aa  178  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  51.94 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  54.04 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  50 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  49.49 
 
 		 214 aa  174  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  51.26 
 
 		 220 aa  171  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10860  riboflavin synthase, alpha subunit  50.72 
 
 		 218 aa  171  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0695867  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  49.25 
 
 		 220 aa  171  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  51.5 
 
 		 221 aa  171  5.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  44.88 
 
 		 218 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  48.77 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  44.83 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  46.23 
 
 		 218 aa  168  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  44.83 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  43.19 
 
 		 232 aa  167  7e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  47.55 
 
 		 201 aa  167  9e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  49 
 
 		 192 aa  167  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  43.78 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  47.74 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  47.29 
 
 		 215 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  44.72 
 
 		 217 aa  165  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0681  riboflavin synthase, alpha subunit  46.8 
 
 		 210 aa  165  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  48.74 
 
 		 219 aa  165  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  46.5 
 
 		 207 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  49.25 
 
 		 223 aa  164  5.9999999999999996e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  48.02 
 
 		 221 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  45.41 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  47.52 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  49.01 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  44.61 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  47.52 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  47.52 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  51.52 
 
 		 215 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  48.24 
 
 		 219 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  50.72 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  47.24 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  47.74 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  46.31 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  47.06 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  48.78 
 
 		 216 aa  161  7e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  47.26 
 
 		 218 aa  160  9e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  47.26 
 
 		 218 aa  160  9e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  46.39 
 
 		 215 aa  159  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  45.41 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  47.24 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  44.08 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  49.5 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  46.23 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  49.5 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  45.1 
 
 		 217 aa  158  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  44.83 
 
 		 221 aa  158  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  43.69 
 
 		 226 aa  157  8e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  45.73 
 
 		 220 aa  157  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  48.5 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  45.73 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  43.13 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  44.5 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  42.29 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  45.23 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 187 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  42.29 
 
 		 214 aa  154  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  41.87 
 
 		 218 aa  154  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 219 aa  153  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>