More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2346 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2378  alanyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 		 889 aa  869    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6094  Alanine--tRNA ligase  50.56 
 
 		 890 aa  795    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0138717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3075  alanyl-tRNA synthetase  53.95 
 
 		 888 aa  881    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 879 aa  645    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2014  alanyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 896 aa  726    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226707  normal  0.142525 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 		 889 aa  860    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12720  alanyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 		 903 aa  843    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  56.07 
 
 		 889 aa  917    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3158  alanyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 		 897 aa  933    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412954  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2320  alanyl-tRNA synthetase  66.3 
 
 		 900 aa  1177    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.871367  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  53.87 
 
 		 892 aa  897    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15270  alanyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 		 888 aa  992    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0205422  normal  0.854238 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2015  alanyl-tRNA synthetase  53.88 
 
 		 898 aa  921    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000286953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 		 892 aa  895    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12510  alanyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 		 893 aa  917    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617945  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  52.24 
 
 		 881 aa  830    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2387  alanyl-tRNA synthetase  99.89 
 
 		 897 aa  1819    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648952  normal  0.0242506 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 878 aa  652    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1689  alanyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 895 aa  776    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1351  alanyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 		 895 aa  829    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0616  alanyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 893 aa  741    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3763  alanyl-tRNA synthetase  87.53 
 
 		 898 aa  1529    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2346  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 897 aa  1820    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413447  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 892 aa  854    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1975  alanyl-tRNA synthetase  67.93 
 
 		 890 aa  1198    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.235306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3878  alanyl-tRNA synthetase  56.14 
 
 		 885 aa  956    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.785303  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5265  alanyl-tRNA synthetase  61.2 
 
 		 890 aa  1083    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  83.28 
 
 		 904 aa  1468    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3297  alanyl-tRNA synthetase  61.43 
 
 		 891 aa  1059    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000320998  normal  0.10569 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2278  alanyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 892 aa  930    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00416969  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1818  alanyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 897 aa  728    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3032  alanyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 		 893 aa  852    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 		 886 aa  801    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2135  alanyl-tRNA synthetase  53.8 
 
 		 889 aa  847    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00198775  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16360  alanyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 902 aa  797    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2407  alanyl-tRNA synthetase  53.92 
 
 		 896 aa  865    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.714506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2393  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 897 aa  1820    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.545162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2640  alanyl-tRNA synthetase  89.2 
 
 		 898 aa  1557    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17690  alanyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 895 aa  854    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.010603  normal  0.139761 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0375  alanine--tRNA ligase  46.9 
 
 		 894 aa  743    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 878 aa  634  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 880 aa  633  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 878 aa  629  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 		 879 aa  627  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 879 aa  626  1e-178  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 881 aa  625  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2626  alanyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 891 aa  622  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.643973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 880 aa  621  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0089  alanyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 879 aa  621  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2598  alanyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 891 aa  617  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2821  alanyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 891 aa  619  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.29967  normal  0.126573 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 876 aa  617  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 877 aa  615  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 880 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5505  alanyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 886 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195836  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3181  alanyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 879 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 877 aa  615  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5834  alanyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 886 aa  609  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227807 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 883 aa  610  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 864 aa  612  1e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 882 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 878 aa  607  9.999999999999999e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5607  alanyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 892 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.346592  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 884 aa  606  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 892 aa  605  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 860 aa  603  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3737  alanyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 891 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0179762  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0877  alanyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 879 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.438968 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 		 903 aa  602  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5448  alanyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 896 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.10309 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 		 876 aa  599  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 877 aa  600  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 		 876 aa  599  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  39.78 
 
 		 876 aa  599  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 		 876 aa  599  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 876 aa  599  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 		 876 aa  599  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05100  alanyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 878 aa  601  1e-170  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.637109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4372  alanyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 889 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2168  alanyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 884 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176955  normal  0.0912251 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 865 aa  600  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0311  alanyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 880 aa  599  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 		 876 aa  599  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1957  alanyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 884 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103878  normal  0.2106 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 882 aa  601  1e-170  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 		 876 aa  598  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 876 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 874 aa  596  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 860 aa  597  1e-169  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1521  alanyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 887 aa  597  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 874 aa  598  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 		 876 aa  597  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 876 aa  597  1e-169  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 		 876 aa  598  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 874 aa  597  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 880 aa  598  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 876 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 874 aa  595  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 865 aa  594  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 874 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>