22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2340 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2340  gas vesicle protein GVPa  100 
 
 		 64 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2387  gas vesicle protein GVPa  100 
 
 		 64 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2381  gas vesicle protein GVPa  100 
 
 		 64 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.817742  normal  0.389389 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2349  gas vesicle protein GVPa  71.74 
 
 		 104 aa  67  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4700  gas vesicle protein GVPa  68.75 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6861  hypothetical protein  69.77 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.178172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1803  gas vesicle protein GVPa  57.14 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3388  gas vesicle protein GVPa  64 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.185348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0704  hypothetical protein  58.33 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1260  gas vesicle protein GVPa  44.23 
 
 		 74 aa  48.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128453  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1813  gas vesicle protein GVPa  55 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0075  gas vesicle protein GVPa  46.43 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0645865  decreased coverage  0.000500428 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0694  putative gas vesicle synthesis protein  50 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.783723 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0071  gas vesicle protein GVPa  44.44 
 
 		 230 aa  45.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0463018  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2330  gas vesicle protein GVPa  57.5 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032613 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2335  gas vesicle protein GVPa  53.66 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00675738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6859  hypothetical protein  47.06 
 
 		 178 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3386  gas vesicle protein GVPa  52.38 
 
 		 134 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.128813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2405  gas vesicle protein GVPa  47.5 
 
 		 119 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2351  gas vesicle protein GVPa  47.5 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4702  gas vesicle protein GVPa  46.51 
 
 		 114 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1262  gas vesicle protein GVPa  38.64 
 
 		 101 aa  40.4  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026389  normal  0.71927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>