69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2338 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2379  gas vesicle protein GVPa  100 
 
 
126 aa  249  7e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2385  gas vesicle protein GVPa  100 
 
 
126 aa  249  7e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14946  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2338  gas vesicle protein GVPa  100 
 
 
126 aa  249  7e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3386  gas vesicle protein GVPa  63.48 
 
 
134 aa  131  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.128813  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4702  gas vesicle protein GVPa  61.9 
 
 
114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6859  hypothetical protein  62.62 
 
 
178 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330028  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2351  gas vesicle protein GVPa  60.2 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0075  gas vesicle protein GVPa  54.65 
 
 
148 aa  100  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0645865  decreased coverage  0.000500428 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2330  gas vesicle protein GVPa  47.31 
 
 
103 aa  97.4  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032613 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1813  gas vesicle protein GVPa  57.14 
 
 
99 aa  92.8  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2335  gas vesicle protein GVPa  49.46 
 
 
104 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00675738 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0694  putative gas vesicle synthesis protein  57.47 
 
 
97 aa  91.7  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.783723 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1262  gas vesicle protein GVPa  44.21 
 
 
101 aa  88.6  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026389  normal  0.71927 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3264  gas vesicle protein GVPa  48.96 
 
 
104 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal  0.701046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4012  gas vesicle protein GVPa  52.43 
 
 
174 aa  87.8  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3580  gas vesicle protein GVPa  48.96 
 
 
104 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2405  gas vesicle protein GVPa  52.7 
 
 
119 aa  84  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0339  gas vesicle protein GVPa  43.66 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4706  gas vesicle protein GVPa  54.24 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.783958  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3025  gas vesicle protein GVPa  40.98 
 
 
123 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.749024  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3114  gas vesicle protein GVPa  47.17 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4008  gas vesicle synthesis-like protein  56.25 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0334  gas vesicle protein GVPa  47.17 
 
 
95 aa  52  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2369  gas vesicle protein GVPa  42.86 
 
 
201 aa  51.6  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0060  gas vesicle synthesis protein GvpA  48.98 
 
 
76 aa  52  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.537884  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0061  gas vesicle synthesis protein GvpA  48.98 
 
 
74 aa  51.6  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0062  gas vesicle synthesis protein GvpA  48.98 
 
 
74 aa  51.6  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0063  gas vesicle synthesis protein GvpA  48.98 
 
 
74 aa  51.6  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2404  gas vesicle protein GVPa  46.15 
 
 
98 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2374  gas vesicle protein GVPa  51.06 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0326  gas vesicle synthesis protein GvpA  50 
 
 
76 aa  50.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0327  gas vesicle synthesis protein GvpA  50 
 
 
76 aa  50.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.516569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0328  gas vesicle synthesis protein GvpA  50 
 
 
76 aa  50.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.518273 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2828  gas vesicle protein GVPa  47.06 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1253  gas vesicle synthesis protein GvpA  40.98 
 
 
72 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2325  gas vesicle synthesis protein GvpA  39.68 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740835  unclonable  0.0000203995 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1748  gas vesicle synthesis protein GvpA  38.46 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0070  gas vesicle protein GVPa  37.5 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471557  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3255  gas vesicle synthesis protein GvpA  39.71 
 
 
70 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0335  hypothetical protein  38.1 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.942024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0078  gas vesicle synthesis protein GvpA  47.83 
 
 
71 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00750449  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3573  gas vesicle synthesis protein GvpA  39.71 
 
 
70 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1006  gas vesicle synthesis-like protein  49.09 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0079  gas vesicle synthesis protein GvpA  45.65 
 
 
71 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.0117948 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1489  gas vesicle protein GVPa  44.68 
 
 
126 aa  47.4  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.510909  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2324  gas vesicle synthesis protein GvpA  45.65 
 
 
75 aa  47  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112837  hitchhiker  0.000242369 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2356  gas vesicle protein GVPa  55.81 
 
 
137 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0939575 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3016  gas vesicle protein GVPa  40 
 
 
71 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6855  hypothetical protein  50 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479937  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3382  gas vesicle protein GVPa  52.5 
 
 
133 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0355765  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1818  gas vesicle synthesis protein GvpA  45.45 
 
 
68 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025131  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1819  gas vesicle synthesis protein GvpA  45.45 
 
 
68 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1820  gas vesicle synthesis protein GvpA  45.45 
 
 
68 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000245848  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1821  gas vesicle synthesis protein GvpA  45.45 
 
 
68 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228865  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0689  gas vesicle synthesis protein GvpA  45.45 
 
 
68 aa  44.7  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.021084  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0688  gas vesicle synthesis protein GvpA  45.45 
 
 
68 aa  44.7  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0200953  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2334  gas vesicle synthesis-like protein  44.19 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2375  gas vesicle synthesis-like protein  44.19 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721458  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2381  gas vesicle synthesis-like protein  44.19 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528325  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2839  gas vesicle synthesis protein GvpA  43.75 
 
 
72 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1803  gas vesicle protein GVPa  40.38 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0686  gas vesicle synthesis protein GvpA  43.18 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0189096  normal  0.509379 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2825  gas vesicle protein GVPa  36.36 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4700  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0704  hypothetical protein  40.82 
 
 
69 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3022  gas vesicle protein GVPa  37.7 
 
 
78 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1499  gas vesicle protein GVPa  45.45 
 
 
76 aa  40.8  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1498  gas vesicle protein GVPa  45.45 
 
 
75 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.921273  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0071  gas vesicle protein GVPa  32.58 
 
 
230 aa  40.4  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0463018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>