42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2167 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2167  LGFP  100 
 
 		 754 aa  1498    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381725  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2213  LGFP repeat-containing protein  100 
 
 		 705 aa  1388    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2440  LGFP repeat-containing protein  55.21 
 
 		 686 aa  652    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199605  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2156  LGFP repeat-containing protein  98.03 
 
 		 706 aa  1259    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337154 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3957  LGFP repeat-containing protein  57.54 
 
 		 708 aa  536  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.420458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12735  hypothetical protein  47.05 
 
 		 699 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.724333 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4327  LGFP repeat protein  30.5 
 
 		 967 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343026  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  31.89 
 
 		 1040 aa  120  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4447  LGFP repeat protein  31.32 
 
 		 695 aa  120  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445822 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  30.35 
 
 		 928 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4038  LGFP repeat protein  29.86 
 
 		 780 aa  106  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.046638 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  27.25 
 
 		 879 aa  89.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2701  LGFP repeat protein  28.76 
 
 		 322 aa  88.2  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2380  LGFP repeat protein  26.34 
 
 		 867 aa  86.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.729285  normal  0.0240945 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  27.43 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  34.94 
 
 		 654 aa  84.3  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1717  LGFP repeat-containing protein  30.81 
 
 		 595 aa  81.3  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.2949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3879  SpoIID/LytB domain  30.37 
 
 		 664 aa  79.7  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0967  SCP-like extracellular  31.07 
 
 		 475 aa  79  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0383584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  33.33 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1965  LGFP repeat protein  36.25 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0039  LGFP repeat protein  28.7 
 
 		 306 aa  73.9  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.06 
 
 		 846 aa  68.6  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3028  LGFP repeat protein  29.06 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  32.18 
 
 		 344 aa  67.4  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4171  LGFP repeat protein  28.02 
 
 		 617 aa  65.5  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  31.01 
 
 		 539 aa  64.7  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0168  putative esterase  37.5 
 
 		 546 aa  62  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  34.62 
 
 		 892 aa  62  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  33.62 
 
 		 541 aa  60.8  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  32.74 
 
 		 539 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  34.23 
 
 		 537 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  34.23 
 
 		 537 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  34.23 
 
 		 537 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  31.39 
 
 		 496 aa  57.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  32.31 
 
 		 399 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2298  hypothetical protein  36.79 
 
 		 300 aa  54.3  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.181107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4477  LGFP repeat-containing protein  33.33 
 
 		 370 aa  54.3  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2565  LGFP repeat protein  33.88 
 
 		 312 aa  52  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.387749  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0197  SpoIID/LytB domain protein  37.8 
 
 		 538 aa  47.8  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  47.92 
 
 		 191 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1016  LGFP repeat protein  34.52 
 
 		 205 aa  45.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>