More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2105 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
180 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
180 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  98.89 
 
 
180 aa  362  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  87.26 
 
 
157 aa  280  6.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  78.95 
 
 
171 aa  278  4e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  77.78 
 
 
179 aa  273  7e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  56.77 
 
 
157 aa  189  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  55.29 
 
 
169 aa  186  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4086  putative transcriptional regulator, AsnC family  59.03 
 
 
169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  47.93 
 
 
203 aa  161  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  52.82 
 
 
171 aa  155  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  52.03 
 
 
168 aa  151  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  45.27 
 
 
157 aa  141  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3154  AsnC/Lrp family regulatory protein  49.33 
 
 
159 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140742  normal  0.198737 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3379  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 
159 aa  135  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6556  transcriptional regulator, AsnC family  46.62 
 
 
158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.604564  normal  0.177628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2850  AsnC family transcriptional regulator  43.48 
 
 
167 aa  131  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2562  transcriptional regulator, AsnC family  42.68 
 
 
167 aa  130  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3951  transcriptional regulator, AsnC family  39.35 
 
 
174 aa  123  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3944  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4274  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 
153 aa  115  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365421  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3819  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 
155 aa  115  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4349  transcriptional regulator, AsnC family  38.78 
 
 
152 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  0.877565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8185  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.78 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0512  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 
165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2159  transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 
157 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.106753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2542  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 
155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.44011  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 
155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  38.85 
 
 
156 aa  108  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  38.85 
 
 
156 aa  108  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4327  transcriptional regulator, AsnC family  38.73 
 
 
154 aa  107  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 
156 aa  107  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4335  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 
173 aa  107  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 
166 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 
166 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 
166 aa  106  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 
166 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 
156 aa  106  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  34.46 
 
 
154 aa  105  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 
164 aa  104  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 
175 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  31.79 
 
 
175 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  32.43 
 
 
158 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  26.85 
 
 
157 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
156 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 
154 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 
158 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
177 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  33.81 
 
 
160 aa  101  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  31.72 
 
 
152 aa  101  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 
175 aa  101  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  36.49 
 
 
166 aa  100  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 
158 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 
152 aa  100  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  37.8 
 
 
156 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 
166 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 
152 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 
152 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
152 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 
161 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 
157 aa  99.8  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  34.23 
 
 
152 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 
152 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 
152 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 
159 aa  99.8  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 
152 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  31.47 
 
 
175 aa  99  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  31.47 
 
 
175 aa  99  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  31.47 
 
 
175 aa  99  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  31.72 
 
 
151 aa  99  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 
164 aa  99  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  31.47 
 
 
229 aa  99  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
159 aa  99  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  35.19 
 
 
176 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  31.47 
 
 
175 aa  99  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 
153 aa  99  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
157 aa  99  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  37.5 
 
 
156 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 
159 aa  99  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
156 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 
166 aa  98.6  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  31.47 
 
 
229 aa  98.2  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 
202 aa  98.2  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  34.46 
 
 
154 aa  97.8  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 
170 aa  97.8  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
162 aa  97.8  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 
154 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  34.25 
 
 
152 aa  97.8  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 
202 aa  97.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  34.01 
 
 
156 aa  97.4  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 
155 aa  97.1  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  34.25 
 
 
152 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  34.25 
 
 
152 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 
175 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 
160 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
154 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  34.25 
 
 
152 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  30.34 
 
 
155 aa  97.1  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
156 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>