More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1998 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  100 
 
 
240 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  100 
 
 
240 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  99.58 
 
 
240 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  88.48 
 
 
241 aa  433  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  86.67 
 
 
233 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  50.68 
 
 
234 aa  234  6e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  50.68 
 
 
234 aa  234  6e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  46.78 
 
 
237 aa  233  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  50.22 
 
 
252 aa  228  5e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  47.51 
 
 
231 aa  226  3e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  49.77 
 
 
228 aa  226  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  48.64 
 
 
230 aa  224  7e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  46.58 
 
 
229 aa  222  4e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  49.32 
 
 
242 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  47.27 
 
 
225 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  46.85 
 
 
238 aa  221  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2507  ABC transporter related  49.55 
 
 
231 aa  221  6e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  46.82 
 
 
225 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  51.36 
 
 
240 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  45.7 
 
 
319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  51.13 
 
 
287 aa  219  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  44.69 
 
 
248 aa  218  6e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.03 
 
 
246 aa  217  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  45.91 
 
 
286 aa  216  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  45.21 
 
 
249 aa  216  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  46.82 
 
 
246 aa  215  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1100  ABC transporter related  48.18 
 
 
236 aa  215  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  47.06 
 
 
237 aa  215  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  49.55 
 
 
228 aa  215  5.9999999999999996e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  44.75 
 
 
244 aa  214  8e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  49.09 
 
 
253 aa  214  9e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  49.09 
 
 
253 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  45.25 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  46.12 
 
 
225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  46.12 
 
 
225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  47.75 
 
 
230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 
222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  48.21 
 
 
237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  48.21 
 
 
237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  46.75 
 
 
653 aa  211  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  42.34 
 
 
232 aa  211  7e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  49.55 
 
 
715 aa  211  7e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  42.08 
 
 
239 aa  211  9e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  43.89 
 
 
237 aa  210  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  44.29 
 
 
260 aa  211  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  45.66 
 
 
242 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4354  ABC transporter related  48.68 
 
 
230 aa  210  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 
233 aa  209  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  47.77 
 
 
236 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  48.86 
 
 
233 aa  209  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  46.15 
 
 
249 aa  209  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  43.89 
 
 
234 aa  208  5e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  45.05 
 
 
266 aa  208  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.15 
 
 
234 aa  208  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  47.35 
 
 
644 aa  208  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  46.61 
 
 
234 aa  208  6e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  43.84 
 
 
232 aa  208  7e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  45.95 
 
 
228 aa  208  7e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  43.89 
 
 
235 aa  208  7e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.12 
 
 
233 aa  208  7e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  46.12 
 
 
232 aa  207  9e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  47.96 
 
 
248 aa  207  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  45.45 
 
 
238 aa  207  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  43.18 
 
 
230 aa  207  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  48.44 
 
 
565 aa  207  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  45.3 
 
 
268 aa  207  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  45.91 
 
 
252 aa  207  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  46.4 
 
 
230 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  47.95 
 
 
239 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  45.5 
 
 
241 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  48.43 
 
 
249 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  46.7 
 
 
238 aa  206  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  47.51 
 
 
228 aa  206  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  45.66 
 
 
228 aa  206  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6611  ABC transporter related  49.77 
 
 
660 aa  206  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  42.99 
 
 
240 aa  206  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3195  putative ABC transporter, ATP-binding protein  49.01 
 
 
227 aa  206  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0270  ABC transporter related  47.75 
 
 
228 aa  206  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.61 
 
 
231 aa  206  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  45.95 
 
 
235 aa  205  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  46.88 
 
 
237 aa  205  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0303  ABC transporter related  45.98 
 
 
232 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0537962  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  47.98 
 
 
248 aa  205  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  43.44 
 
 
234 aa  205  5e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  45.95 
 
 
657 aa  205  5e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  42.34 
 
 
231 aa  205  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2803  ABC transporter related  45.98 
 
 
232 aa  205  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0893633  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29510  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.82 
 
 
250 aa  205  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  46.12 
 
 
249 aa  205  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3170  ABC transporter related protein  46 
 
 
217 aa  205  6e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0178954  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0206  ABC transporter related  47.37 
 
 
232 aa  205  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  unclonable  0.000000000007713 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  42.08 
 
 
226 aa  204  7e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  45.91 
 
 
248 aa  204  8e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8342  ABC transporter related  48.65 
 
 
234 aa  204  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  45.02 
 
 
248 aa  204  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  45.02 
 
 
248 aa  204  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  44.55 
 
 
225 aa  204  9e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  44.8 
 
 
252 aa  204  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  42.73 
 
 
235 aa  204  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  43.89 
 
 
234 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>